免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用：低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質之間的相互作用可能檢測不到，這可能導致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用：免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質的結合可能不是直接結合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制：免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術，如親和色譜，這可能影響到對低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高：如果將蛋白復合物直接進行質譜分析，需要得到較高純度和濃度的蛋白復合物樣品，這并非易事，并且成本較高。對抗體要求高：用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適，與Western blotting或者 ELISA相比容易出現假陽性反應。IP-Mass技術結合免疫沉淀與質譜分析，研究蛋白互作與差異，助力生物醫學研究！河北相互作用蛋白檢測CoIP-mass spectrometry檢測
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一種經典的用于研究蛋白質相互作用的方法，它基于抗體和抗原之間的專一性作用。該技術主要用于確定兩種蛋白質在完整細胞內的生理性相互作用。基本原理：當細胞在非變性條件下被裂解時，細胞內蛋白質-蛋白質間的相互作用被保留下來。通過利用預先固化在agarose beads上的蛋白質A的抗體來免疫沉淀A蛋白，與A蛋白在體內結合的蛋白質B也能一起沉淀下來。隨后，通過蛋白變性分離，可以對B蛋白進行檢測，從而證明兩者之間的相互作用。重慶CoIP-mass spectrometry檢測IP-Mass技術是一種結合了免疫沉淀和質譜分析的方法。
免疫共沉淀實驗步驟主要包括以下五個部分：樣品處理：將細胞或組織樣品進行裂解，得到待檢測的蛋白質混合物，并加入蛋白酶抑制劑以避免目標蛋白被降解。抗體處理：將專一的抗體連接到親和樹脂上，如蛋白A的親和樹脂或蛋白G的親和樹脂，或將蛋白與其特異性抗體結合，新形成的復合物與封閉劑緩慢搖擺在二氧化硅珠上，使碘酸鈣交聯后節制反應。免疫共沉淀：將有抗體樹脂的樣品與吸附抗體樹脂形成免疫復合物。洗滌：采用洗滌緩沖液對樣品進行洗滌，以去除非特異性的蛋白質和雜質，同時盡量避免對復合物的影響。洗滌緩沖液選擇對樣品不會引起較大影響的緩沖液和洗滌劑。蛋白鑒定：將沉淀的復合物通過SDS-PAGE分離出來，并進行Western blotting檢測目標蛋白及其配偶蛋白。另一方面，也可以直接使用質譜分析檢測。
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點：
互作蛋白篩選和驗證：數據分析以非標定量信號強度（LFQintensity和FC>10）作為強陽篩選，以文獻查閱，功能匹配，批量CoIP-WB驗證，提高驗證成功率。理想CoIP-MS結果的蛋白定量都到超過1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號強度和差異倍數作為參考（相對強信號和差異），分析實驗組中明顯定量較高且差異較大的蛋白，作為重要候選蛋白。同時對重要候選蛋白進行STRING互作分析，文獻分析，目的蛋白功能匹配分析，選擇Top的4-5個蛋白進行CoIP-WB驗證，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP實驗要點：樣品新鮮、抗體特異、偶聯充分、洗滌徹底，確保結果準確可靠！
IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）實驗流程主要包括以下步驟：樣品制備：收集細胞或組織樣品，進行適當的裂解處理，以釋放細胞內的蛋白質。免疫沉淀：將特異性抗體與目標蛋白結合，形成抗原-抗體復合物。隨后，將復合物與固相載體（如磁珠）結合，通過洗滌去除非特異性結合的雜質。電泳分離：將免疫沉淀得到的蛋白質復合物進行SDS-PAGE凝膠電泳，根據分子量大小將蛋白質分離成不同的條帶。轉膜：將凝膠上的蛋白質轉移到固相膜上，以便進行后續的Western Blot檢測。Western Blot檢測：利用特異性抗體檢測目標蛋白或其相互作用伙伴的存在。通過顯色反應可視化目標蛋白，觀察并記錄結果。以上步驟完成后，可以對Western Blot結果進行分析，從而驗證蛋白質之間的相互作用情況。CoIP實驗內源檢測與外源檢測的優缺點。內蒙古免疫共沉淀檢測CoIP-WB
Co-IP技術直接、特異、靈敏，是研究蛋白質相互作用的有力工具，揭示生命奧秘！河北相互作用蛋白檢測CoIP-mass spectrometry檢測
Co-IP（免疫共沉淀）技術是一種在生物學研究中廣泛應用的實驗方法，主要用于研究蛋白質之間的相互作用。該技術利用特異性抗體與目標蛋白結合，形成免疫復合物，并通過與磁珠或瓊脂糖等固相支持物的結合，將復合物從復雜的細胞或組織提取物中分離出來。這種分離過程是在非變性條件下進行的，因此可以保留蛋白質間的天然相互作用狀態。Co-IP技術的主要優勢在于其直接性、特異性和靈敏度。通過選擇特異性強的抗體，研究人員能夠準確地捕獲目標蛋白及其相互作用伙伴，從而揭示蛋白質在生命過程中的功能和調控機制。此外，該技術還可以用于研究間接相互作用的蛋白，如蛋白復合物的多種成分。總之，Co-IP技術為深入研究蛋白質相互作用提供了有力工具，有助于揭示蛋白質在生命活動中的重要作用。河北相互作用蛋白檢測CoIP-mass spectrometry檢測