采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發生***改變（2201個下調，1548個上調），560個基因（430個下調，130個上調）因攝入AL而發生***改變（圖3B）。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個（約占總鑒定蛋白質的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質發生***變化（109個上調，121個下調），AL處理有211個蛋白質發生***變化（116個上調，95個下調）。蛋白質組學質譜分析蛋白質組學三大基本技術。江蘇蛋白組學服務公司
TMTpro-16plex等標記試劑已經發布一年，廣受科研工作者喜愛。但是，對于6組3重復、3組6重復的實驗設計，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質譜儀平臺的蛋白組學近年來備受青睞，穩定同位素標記策略也被廣泛應用于多重定量蛋白質組學中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標記蛋白組，18個樣本以內，可實現一次標記和分級，避免了多批次標記引入的批次效應，能***提升樣本的數據質量。同時對更多蛋白質鑒定和定量，提供了樣本的多通路處理水平。這個技術可謂是2021年的又一創新技術。浙江蛋白組學的結果怎么分析歐易生物鹿明生物蛋白組學聯合分析。
作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題：氮調節茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質水平調節研究對象：茶樹根發表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發表時間：2021年9月1日發表單位：安徽農業大學運用生物技術：TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數據分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數據探索了調節機制。本文的多組學數據整合分析思路值得借鑒。
作者使用通過單細胞蛋白組學產生的數據來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質細胞。208個Glom富集區蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調節作為其**重要的生物學過程，細胞骨架蛋白結合和肌動蛋白結合是**重要的分子功能，肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中，這些蛋白質的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發現的67種蛋白質中，有41種已被報導存在于腎臟中，在這41種蛋白質中，18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結果一致，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學 差異表達蛋白質組分析研究。
作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發育過程中蛋白質表達的定量比較，同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性，以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的，作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。定量蛋白質組學 蛋白質進行質譜檢測未知蛋白進行全檢測。江西藥物的蛋白組學
蛋白質組學-鹿明生物丨歐易生物。江蘇蛋白組學服務公司
蛋白組學研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫藥大學教育部中醫養生學重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法，發現了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理。為預防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據。江蘇蛋白組學服務公司
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