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上海代謝組學 數據處理

來源: 發布時間:2022-09-21

LC-MS非靶向代謝組學研究方法,2021年11月,寧波大學海洋科學學院王春琳團隊在Frontiers in Marine Science期刊發表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通過LC-MS非靶向代謝組學研究方法,發現了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應鹽度變化的主要因素,而脂質代謝物起輔助作用。中文標題:青蟹在適應鹽度急劇下降過程中的代謝變化研究對象:青蟹發表期刊:FrontiersinMarineScience影響因子:4.912發表時間:2021年11月2日合作單位:寧波大學應用海洋生物技術教育部重點實驗室運用生物技術:LC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術支持)代謝組學專業第三方檢測,出具報告快,數據準。上海代謝組學 數據處理

通過轉錄組學和代謝組學(GC-MS非靶向代謝組學)對BPF暴露和對照組的細胞進行分析,篩選到差異的基因和代謝物。分別通過富集分析,找到差異基因或代謝物參與的條目或通路。***通過差異轉錄本、代謝物和促炎細胞因子的綜合分析,揭露了它們之間的關系。本文通過多組學分析和體外模型的方式,發現了BPF暴露后腸上皮細胞轉錄組和代謝組譜的改變,揭露了BPF可能在腸道炎癥發病機制的作用。中文標題:轉錄組學結合代謝組學揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學附屬新華醫院運用生物技術:GC-MS非靶向代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)、轉錄組學、qRT-PCR上海代謝組學 方法與應用讀懂代謝組學 代謝組學的研究范疇。

LC-MS和GC-MS兩大平臺是現今代謝組學研究**常用的兩大技術平臺,各自有其特點和優勢,在物質檢測的范圍和種類上,都有一定的偏向性。往往一種方法、一個技術平臺很難獲取樣品當中***的代謝物信息,為了解決這個問題,LC-MS+GC-MS這種組合式雙平臺解決方案,可以**提升代謝組學檢測的覆蓋度,獲取更加***的代謝物及其豐度信息,鹿明生物運用此研究策略,已協助更多客戶更好的達成了科研目標。鹿明生物、歐易生物雙平臺代謝組學可***研究代謝物的信息,為您的科學研究助力。

代謝組學數據提供了COVID-19患者各階段循環代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發現隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D);與正常組對比,***上調的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據發現隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。代謝組學 生物標志物挖掘**-歐易生物。

LC-MS非靶向代謝技術發現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響。標題:藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠小腸、腸道內容物、血漿*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組、轉錄組、16S微生物多樣性檢測等本研究發現藻酸鹽寡糖(AOS)可以減輕***藥物白消安誘導的小腸細胞膜的損傷,特別是細胞連接和微絨毛;并有利于腸道菌群變化進而改善小腸功能,提高腸道的免疫功能。LC-MS非靶向代謝技術發現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,并分析了血液代謝物與腸道菌群之間的相關性,發現不同劑量的糞便移植對血液代謝組均產生了***影響,其中大部分是在小腸功能中起著重要作用的脂質代謝物,表明FMT可以在血液中恢復被白消安擾亂的代謝物。相關性分析表明,“有益菌”乳酸桿菌有助于血液代謝產物的恢復,“有害菌群”則不能協助血液代謝物的回收,揭示了FMT可改善小腸功能和腸道菌群,恢復血液代謝的原因。代謝組學多年質譜組學系統研究經驗。上海糖代謝組學

對生物體內所有代謝物進行定量分析-代謝組學。上海代謝組學 數據處理

GC-MS非靶向代謝組學yan'j2021年11月,上海交通大學醫學院附屬新華醫院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學和轉錄組學研究方法,發現了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發病機理。

中文標題:轉錄組學結合代謝組學揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學附屬新華醫院運用生物技術:GC-MS非靶向代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)、轉錄組學、qRT-PCR 上海代謝組學 數據處理

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