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貴州靶向代謝組學應用

來源: 發布時間:2022-01-10

LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質聯用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產物的動態變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發或熱穩定性差的代謝產物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯質譜儀在MS掃描模式下,可實現高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質譜信息,結合代謝組學數據處理軟件對質譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。貴州靶向代謝組學應用

代謝組學介紹:通過液質聯用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大多是分子量1500Da以內的小分子物質。技術優勢:較高的靈敏度、分辨率;較寬的動態范圍;適合對標本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向: 土壤代謝組學。研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調節、控制和改善土壤環境質量提供重要的參考。湖北非靶向代謝組學研究方法什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?

代謝組學需要多少的生物學重復?生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環境和遺傳背景等因素影響較大,生物學重復少可能會放大組內差異對于整體差異的影響,進而影響結果(如準確和足夠多的找出生物標志物)。因此根據不同的生物類型,需要不同的生物學重復來增加數據的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。

代謝組學的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據研究的對象和目的不同,科學家將生物體系的代謝產物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結構、性質相關的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內特定組織內的代謝產物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預或病理生理條件下的動態變化規律。代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?

代謝組學細胞樣本收集:懸浮細胞:1)連同培養基轉移到1.5 mL的進口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細胞沉淀于離心管的底部(1*107個細胞為宜)。3)倒掉培養基(盡量倒干凈),用預冷的PBS反復沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項:1. 培養基傾倒時盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養液吸凈;2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規格;3. 液氮淬滅細胞時,請小心避免離心管破碎導致樣本受損;4. 建議細胞樣本在進行培養時多準備樣本,以備后續使用。較低的費用,是促使代謝組學在臨床上易于接受的另一個原因。湖北非靶向代謝組學研究方法

代謝組學可與生物表型變化建立直接相關性。貴州靶向代謝組學應用

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統代謝組學研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確(比如異構體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學的重要方法。貴州靶向代謝組學應用

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