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四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-01-10

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù),該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標(biāo)記和定量,將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標(biāo)記),從而簡化了定量的復(fù)雜性,然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值,從而測定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異。iTRAQ定量不依賴樣本,可檢測出較低豐度蛋白,胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量準(zhǔn)確,可同時對8個樣本進(jìn)行分析,并可同時得出鑒定和定量的結(jié)果,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹:Label-free:Label-free定量,即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高,準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差。因此,Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標(biāo)記定量實現(xiàn)的實驗設(shè)計。南京修飾蛋白組學(xué)技術(shù)服務(wù)蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng),也是一個整體的概念。

蛋白組學(xué)技術(shù):蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術(shù)。為達(dá)到這一要求,就需要樣品準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)獲取標(biāo)準(zhǔn)化及自動化,也就是要有可重復(fù)的高通量的技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質(zhì)樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質(zhì)譜技術(shù)、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質(zhì)微陣列技術(shù)、能進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計算機系統(tǒng)和軟件、軟電離技術(shù)及生物信息學(xué)技術(shù)構(gòu)成了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)體系。其中蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)中的質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?研究對象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白,理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來說,蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支:非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質(zhì)組學(xué)(對生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測定),修飾蛋白質(zhì)組學(xué)(對蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測)及相互作用蛋白質(zhì)組研究(蛋白質(zhì)直接相互作用機制解析)等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時代的科學(xué)研究,針對基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理條件下的水平與狀態(tài)。蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容,通過對基因表達(dá)產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達(dá)情況。近年來,隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(xué)(“Shotgun”proteomics)技術(shù),特別是多維蛋白質(zhì)鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復(fù)雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達(dá)和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)。深圳蛋白質(zhì)定量組學(xué)方法

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有生物質(zhì)譜。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)組學(xué)概念:蛋白質(zhì)組學(xué)(英語:proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識。四川DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

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