蛋白質組學主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。蛋白質組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術：非靶向蛋白組學：蛋白質定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學。蛋白質組可以隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。廣州4D定量蛋白質組學質譜鑒定

定量蛋白質組學技術：定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內容，通過對基因表達產物——蛋白質的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來，隨著非凝膠技術的發展，蛋白質組學（“Shotgun”proteomics）技術，特別是多維蛋白質鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復雜生物樣本中大規模蛋白質表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學。廣州4D定量蛋白質組學質譜鑒定蛋白質組的研究能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。

蛋白質組學技術：飛行時間質譜：MALDI的基本原理是將分析物分散在基質分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶體，當用激光（337nm的氮激光）照射晶體時，基質分子吸收激光能量，樣品解吸附，基質-樣品之間發生電荷轉移使樣品分子電離。它從固相標本中產生離子，并在飛行管中測定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽質量指紋圖譜，非常快速（每次分析只需3~5min），靈敏（達到fmol水平），可以精確測量肽段質量，但是如果在分析前不修飾肽段，MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列。

Labelfree非標記定量蛋白質組學技術特點：（1）不需要標記處理，操作簡單，成本低、實驗周期短；（2）每個樣品單獨處理、上機；（3）可以做任意樣本的總蛋白質差異定量，樣品類型不受限制；（4）對單個樣品的蛋白總量要求相對較低，對于組織本身蛋白量不高，可以選擇Label-Free，適用于一些難收集樣品；（5）定性沒有問題，但是定量的準確性較標記定量稍差，會受到質譜穩定性等因素的影響；（6）適合于大樣本量的定量比較（大于24個樣本）。蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學。蛋白質組的研究能為生命活動規律提供物質基礎。

蛋白質組學：蛋白質組一詞，源于蛋白質與基因組兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。蛋白質組的研究不只能為生命活動規律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”，它們可成為新藥物設計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實，那些世界范圍內銷路*的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此，蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業帶來巨大的利益。近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域，如細胞生物學、神經生物學等。蛋白質組學項目

質譜技術相較于傳統蛋白質鑒定技術而言，擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。廣州4D定量蛋白質組學質譜鑒定

蛋白質組的研究不但能為生命活動規律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”，它們可成為新藥物設計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實，那些世界范圍內銷路比較好的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此，蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業帶來巨大的利益。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。廣州4D定量蛋白質組學質譜鑒定

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