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內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR

來源: 發(fā)布時間:2024-11-23

RIP實驗的目的是使用RIP-seq或者RIP-qPCR的方法,通過在目的細胞中運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,經(jīng)過分離純化并對結合在復合物上的RNA進行測序或qPCR分析,尋找目標蛋白的互作RNA分子,或在不同遺傳背景或處理條件下的互作變化。廣州基云生物擁有ZI深的項目管理ZHUAN家和經(jīng)驗豐富的技術團隊,為您提供專業(yè)的研究方案、嚴格項目質(zhì)控、科學的數(shù)據(jù)分析,為您的互作機制提供專業(yè)建議,助力您快速獲取互作機制分子,突破互作機制研究瓶頸難題。RIP-qPCR實驗技術有哪些應用場景。內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR

RIP實驗RNA結合蛋白-RNA復合物的免疫沉淀(RIP)免疫沉淀方法:

將所有的試管在4°C下旋轉孵育3小時至過夜。

將免疫沉淀管短暫離心,放置在磁性分離器上,棄用上清液。

從磁鐵上取下試管。每管中加入0.5mLRIP洗滌緩沖液,短暫渦旋。(重復清洗5次)

后面一次洗滌中,將500μL的珠子懸液中各取出50μL,通過免疫印跡法檢測免疫沉淀的效率。在1XSDS-PAGE加載緩沖液中重新懸浮珠子,然后在95°C加熱,可以洗脫蛋白質(zhì)。然后可以離心,上清液直接應用于SDS-PAGE上。 新疆RNA蛋白相互作用RIP qPCR進行RIP-qPCR實驗,應該注意哪些關鍵問題,以確保實驗的成功和準確性。

做好RIP-qPCR實驗,需要做好以下準備:一、實驗材料與試劑。細胞或組織樣本:確保樣本新鮮、無污染,并符合實驗需求。特異性抗體:針對目標RNA結合蛋白的抗體,用于免疫沉淀。qPCR引物:特異性針對目標RNA的引物,用于后續(xù)定量檢測。RIP裂解液、洗滌液等試劑:確保實驗流程順利進行。二、儀器與設備。qPCR儀:用于進行實時熒光定量PCR反應。離心機:用于沉淀和洗滌步驟中的離心操作。磁力架:如使用磁珠進行免疫沉淀,需磁力架輔助。三、實驗前準備。查閱文獻,明確實驗目的和流程,設計好實驗方案。檢查試劑耗材是否齊全,避免實驗中斷。對實驗環(huán)境進行清潔和消毒,確保無菌操作。四、實驗操作規(guī)范。嚴格遵守RNA操作規(guī)范,避免RNA降解。確保所有步驟在適當?shù)臏囟群蜁r間下進行。注意實驗安全,佩戴手套、護目鏡等防護用品。總之,做好RIP-qPCR實驗需要充分的實驗準備,包括實驗材料與試劑、儀器與設備、實驗前準備以及嚴格的實驗操作規(guī)范。只有充分準備,才能確保實驗的順利進行和結果的準確性。

RIP實驗將RNA反轉錄成cDNA的方法:

標記適當數(shù)量的0.2mLPCR管,以供分析的樣本數(shù)量,并放在冰上。

將9μL(多2μg)的RNA加入PCR管中,放在冰上。

在每個PCR反應管的在冰上加入適量的試劑。

將PCR反應管置于熱循環(huán)器中。

啟動以下RT反應程序:37℃,1h;95℃,5min,4℃保存。

取下PCR管。用180μL無核酸酶水(稀釋10倍)稀釋產(chǎn)物。產(chǎn)物可以存儲在-20°C。

廣州基云生物,在IP互作組檢測和關鍵機制分子篩選驗證領域,具有豐富的經(jīng)驗,助力您的互作機制研究。 RIP實驗技術原理是什么。

RIP-Seq檢測和RIP-qPCR驗證優(yōu)劣勢:優(yōu)勢:高通量獲得目的蛋白的專屬RNA互作庫,獲得目的蛋白的互作RNA機制分子。劣勢:RIP-Seq的RNA庫魚龍混雜,包含目的蛋白的直接/間接的互作RNA,非特異結合,殘留RNA。RIP-Seq技術和分析門檻高;RIP-qPCR驗證成功率低,導致研發(fā)進展反復跌宕、時間和經(jīng)費成本占用較大,嚴重影響士氣。該項目的成功實施,比較依賴成熟和有分析經(jīng)驗的團隊,強烈建議整包交給專業(yè)的服務商開展檢測。

廣州基云專注互作機制研究,致力于讓實驗更簡單高效。 若想要快速了解RIP-qPCR實驗技術,可以采取哪些方法。上海RNA蛋白相互作用RIP-Sequencing檢測

RIP-seq實驗廣泛應用于研究全基因組RNA-蛋白質(zhì)相互作用及轉錄后調(diào)控機制。內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR

RIP-qPCR是一種檢測細胞內(nèi)蛋白/RNA互作的靶向驗證技術。該技術通過聯(lián)合免疫共沉淀技術和RT-qPCR檢測技術,對目的蛋白在特定細胞/組織內(nèi)的蛋白/RNA互作關系進行驗證,明確蛋白/RNA的相互作用關系。該技術適用于目的蛋白在特定細胞/組織中的蛋白/RNA互作檢測驗證,或用于不同遺傳背景/實驗條件下的互作差異研究。因此,該技術是研究細胞內(nèi)蛋白/RNA互作調(diào)控網(wǎng)絡的常規(guī)檢測技術。

RIP-qPCR:用于驗證目的蛋白和候選RNA的相互作用關系,或用于不同遺傳背景/實驗條件下的互作變化。 內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR

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