免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用：低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質之間的相互作用可能檢測不到，這可能導致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用：免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質的結合可能不是直接結合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制：免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術，如親和色譜，這可能影響到對低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高：如果將蛋白復合物直接進行質譜分析，需要得到較高純度和濃度的蛋白復合物樣品，這并非易事，并且成本較高。對抗體要求高：用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適，與Western blotting或者 ELISA相比容易出現假陽性反應。Co-IP探究蛋白互作，ChIP研究轉錄調控，各擅勝場，選擇需依研究目標！廣東免疫共沉淀CoIP-Western Blot
在CoIP（免疫共沉淀）實驗中，對照組的設計對實驗結果尤為重要，陽性對照組設計建議如下：1. 已知相互作用蛋白對照組：如果可能的話，使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽性對照。這可以驗證實驗條件的可行性，以及抗體和實驗方法的可靠性。2. 設置過量誘餌蛋白對照組：通過加入過量的誘餌蛋白，可以驗證靶蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用是否具有飽和性。如果加入過量誘餌蛋白后，靶蛋白的結合減少或消失，則表明相互作用具有飽和性。四川互作機制CoIP Western Blot入門Co-IP實驗，需理解原理、選對抗體、處理樣本、嚴控操作，安全細心，不斷積累經驗！
Co-IP實驗的內源檢測注意事項如下：首先，確保使用的抗體具有高特異性和親和力，這是內源檢測成功的關鍵。由于細胞內蛋白表達復雜，非特異性結合可能導致實驗結果失真。其次，嚴格控制實驗條件，如細胞裂解和洗滌條件，以避免破壞蛋白質相互作用或引入非特異性蛋白。溫和地釋放細胞內蛋白，保證釋放出的蛋白不被蛋白酶分解，同時實驗過程需保持低溫。此外，注意樣本的采集和處理。樣本應盡快處理，避免蛋白降解，同時防止樣本在運輸過程中溫度過高導致變質。另外，結合其他實驗方法進行驗證，如Western Blot等，以確認Co-IP實驗結果的可靠性。綜上所述，Co-IP實驗的內源檢測需要關注抗體選擇、實驗條件控制、樣本處理以及結果驗證等方面，以確保實驗結果的準確性和可靠性。
IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）技術的缺點主要包括以下幾個方面：抗體特異性要求：IP-WB技術對抗體的特異性要求極高。如果抗體特異性不強，可能會導致非特異性結合，增加背景噪聲，影響結果的準確性。低豐度蛋白檢測難度：由于IP-WB技術的靈敏度限制，對于低豐度的蛋白質相互作用，可能難以檢測到。操作復雜性：IP-WB技術涉及多個步驟，包括樣品制備、免疫沉淀、電泳分離和Western Blot檢測等，操作相對復雜，需要一定的實驗經驗和技能。結果解讀難度：Western Blot結果可能受到多種因素的影響，如蛋白表達水平、抗體親和力等，結果解讀可能具有一定的難度。雖然IP-WB技術存在一些缺點，但通過選擇特異性強的抗體、優化實驗條件、提高實驗技能等方法，可以很大程度地減少這些缺點對實驗結果的影響。CoIP實驗需設陽性對照，驗證相互作用，確保實驗可靠性！
免疫共沉淀也存在一些局限性。例如，它可能無法檢測到低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質相互作用。此外，兩種蛋白質的結合可能不是直接結合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。此外，實驗前需要預測目的蛋白以選擇相應的抗體，因此，如果預測不正確，實驗可能無法得到結果，這使得這種方法具有一定的冒險性。總的來說，免疫共沉淀是一種強大的技術，它能夠為我們提供關于蛋白質相互作用的寶貴信息。然而，為了得到準確和可靠的結果，我們需要謹慎地解釋和分析實驗數據，并考慮到這種方法的局限性。IP-Mass（免疫沉淀-質譜）技術應用場景。中國香港免疫沉淀檢測CoIP-MS檢測
免疫共沉淀實驗：樣品處理、抗體處理、共沉淀、洗滌及鑒定，一氣呵成！廣東免疫共沉淀CoIP-Western Blot
IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）實驗流程主要包括以下步驟：樣品制備：收集細胞或組織樣品，進行適當的裂解處理，以釋放細胞內的蛋白質。免疫沉淀：將特異性抗體與目標蛋白結合，形成抗原-抗體復合物。隨后，將復合物與固相載體（如磁珠）結合，通過洗滌去除非特異性結合的雜質。電泳分離：將免疫沉淀得到的蛋白質復合物進行SDS-PAGE凝膠電泳，根據分子量大小將蛋白質分離成不同的條帶。轉膜：將凝膠上的蛋白質轉移到固相膜上，以便進行后續的Western Blot檢測。Western Blot檢測：利用特異性抗體檢測目標蛋白或其相互作用伙伴的存在。通過顯色反應可視化目標蛋白，觀察并記錄結果。以上步驟完成后，可以對Western Blot結果進行分析，從而驗證蛋白質之間的相互作用情況。廣東免疫共沉淀CoIP-Western Blot