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來源: 發布時間:2021-09-22

上皮型鈣黏附素(E-cadherin)是介導細胞間粘附的一種跨膜糖蛋白,其編碼基因CDH-1屬于**侵襲轉移抑制基因。在**組織中,E-cadherin表達的下調或沉默可導致細胞間相互黏附力減弱,造成**細胞的分散,脫離原發灶處而轉移。而E-cadherin下調的因素之一就是其啟動子區域CpG島的超甲基化。**細胞突破血管內皮及基底膜進入血循環是**細胞侵襲和轉移的重要步驟?;啄そM成蛋白Nidogen的缺失將嚴重影響基底膜的完整性,有利于**細胞順利通過進入血循環進而發生侵襲轉移。有研究表明,Nidogen基因啟動子在**細胞中表現出很高的甲基化水平,而在正常細胞中卻極少或沒有發生甲基化。另外,某些miRNA(如MiR-148a、miR-34b/c、miR-9)能夠起到抑制**細胞生長和轉移的作用,而在**細胞中,這些miRNA通常由于發生超甲基化而沉默。中小樣本篩選, 大樣本中進一步驗證。四川oxBSDNA甲基化口碑推薦

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甲基化DNA免疫沉淀測序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、高效地尋找甲基化區域。可廣泛應用于甲基化與疾病關系研究。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>50ng/ul;無RNA和蛋白污染,建庫測序:測序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測序深度:20-30Mreads。信息分析:基于全基因組范圍的羥甲基化分析,數據質控,Peak鋒Calling,Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本羥甲基化差異聚類,差異羥甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析,結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。

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