芯片平臺作為目前比較成熟的篩選工具，已經在很多領域有了相應的應用。多家芯片公司在DNA甲基化這塊兒有了相應的產品提供，其中應用**為***的就Agilent平臺和Illumina平臺，相應的產品包括Agilent Human CpG Island Microarray Kit，Infinium HumanMethylation27 BeadChip和Infinium HumanMethylation450K BeadChip。另外Roche NimbleGen和Affymetrix也有相應的芯片推出，但是NimbleGen的芯片今年下半年已經停產不同的芯片平臺，各自的實驗過程也是不一樣的。安捷倫前期采用的甲基化DNA免疫共沉淀（MeDIP）技術。將基因組DNA分成兩份，一份用來做 MeDIP，另一份作為對照。兩個樣品都標記熒光(富集的樣品用Cy5標記，對照用Cy3標記)，然后與芯片雜交。芯片上每個探針的Cy5/Cy3強度比例顯示出該區域的甲基化程度。ChIP-Seq 能實現真正的全基因組分析。上海MeDIP-SeqDNA甲基化方案

低甲基化，原*基因***正常細胞中，由于甲基化作用原*基因多處于沉默狀態，但在多種**細胞中，均發現原*基因處于低甲基化狀態，并且低甲基化狀態與其蛋白表達升高密切相關，表明低甲基化狀態可使原*基因***。轉座子活化轉座子是可移動的基因序列，包括LINE-1、HERV-K等，在人類基因組中含量豐富，正常情況下處于被甲基化狀態而轉錄沉默。而在**細胞中，由于基因組總體甲基化水平的降低，這些序列也因去甲基化而活化，轉移位置導致基因片段的插入和缺失。天津hMeDIP-SeqDNA甲基化歡迎咨詢人類基因組有約56M的CpG位點，CpG島約3萬個。

NA甲基化（DNA methylation）是指在DNA甲基化轉移酶（DNMT）催化下，以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體，將活性甲基轉移至DNA鏈中特定堿基上的化學修飾過程。哺乳動物基因組中，DNA甲基化多發生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一種表觀（epigenetic）修飾，它在不改變DNA序列的情況下，對個體的生長、發育、基因表達模式以及基因組的穩定性起到重要的調控作用，并且這種修飾在發育和細胞增殖的過程中是可以穩定傳遞的。近年來的大量研究表明，DNA異常甲基化與**的發生、發展、細胞*變有著密切的聯系。

高通量BSP——目標位點/基因甲基化驗證方案。科學方案：設計從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數據分析每個項目有特定的科學問題；需要專業、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果。樣本要求：基因組DNA:>=1ug(20個區域/位點)；樣品濃度>30ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150；測序深度：>100X。信息分析：基于靶向序列的甲基化分析，數據質控，5mCCalling，5mC在組間樣本的可視化，多樣本甲基化聚類與臨床樣本特征關聯分析等。中小樣本篩選, 大樣本中進一步驗證。

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上皮型鈣黏附素（E-cadherin）是介導細胞間粘附的一種跨膜糖蛋白，其編碼基因CDH-1屬于**侵襲轉移抑制基因。在**組織中，E-cadherin表達的下調或沉默可導致細胞間相互黏附力減弱，造成**細胞的分散，脫離原發灶處而轉移。而E-cadherin下調的因素之一就是其啟動子區域CpG島的超甲基化。**細胞突破血管內皮及基底膜進入血循環是**細胞侵襲和轉移的重要步驟。基底膜組成蛋白Nidogen的缺失將嚴重影響基底膜的完整性，有利于**細胞順利通過進入血循環進而發生侵襲轉移。有研究表明，Nidogen基因啟動子在**細胞中表現出很高的甲基化水平，而在正常細胞中卻極少或沒有發生甲基化。另外，某些miRNA（如MiR-148a、miR-34b/c、miR-9）能夠起到抑制**細胞生長和轉移的作用，而在**細胞中，這些miRNA通常由于發生超甲基化而沉默。上海MeDIP-SeqDNA甲基化方案