industryTemplate云生物提供甲基化服務。陜西RRBSDNA甲基化經驗豐富

羥甲基化DNA免疫沉淀測序（HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，hMeDIP-Seq）是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找羥甲基化區域。可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發育過程中的研究。樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150;測序深度：20-30Mreads。信息分析：基于全基因組范圍的羥甲基化分析，數據質控，Peak鋒Calling，Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布，多樣本羥甲基化差異聚類，差異羥甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。上海oxBSDNA甲基化專業服務WGBS技術及應用是有力方案。

安捷倫公司芯片平臺因其強大的eArray探針設計平臺，可以進行芯片的定制。在甲基化領域同樣適用。合作伙伴利用Agilent芯片平臺設計了一款專門針對**啟動子區域CpG島的甲基化芯片。絕大多數基因是針對基因的啟動子區域的CpG島設計探針。這款芯片上一共有4160個功能注釋比較明確的基因，其中2128個和**發生有關系。從功能上分，有256基因和細胞凋亡有關，1273個基因和信號傳導有關，487個基因和壓力和衰老有關。采用的是8*60K的芯片格式。利用MeDIP原理進行甲基化檢測的方法探針的分辨率可以精確到100 bp。

強化RRBS——高性價比DNA甲基化檢測方案。單堿基分辨率，全基因組范圍，富集啟動子/CpG島甲基化調控區域，適合人和哺乳動物、動物及魚類，適合細胞、全血及新鮮冷凍組織，不適合cfDNA及FFPE等片段化樣本。項目介紹：簡化基因組甲基化測序(ReducedRepresentationBisulfiteSequencing,RRBS)是通過限制性酶切的方法富集基因組DNA上富含CCGG位點的片段，經Bisulfite處理和高通量測序技術進行基因組CpG富集區域內的單堿基分辨率的甲基化測序。相對WGBS而言RRBS技術作為高性價比的甲基化測序方案，測序量大幅減少，在大規模臨床樣本研究中具有很不錯的應用價值。高通量BSP測序結果多種展示形式。

芯片種類：Agilent**甲基化芯片，8x60K●和合作伙伴在Agilent公司定制的Promoter芯片。●絕大多數基因是針對基因啟動子區域的CpG島設計探針。●芯片上一共有4160個功能注釋比較明確的基因，其中2128個和**發生有關系。●從功能上分，有256基因和細胞凋亡有關，1273個基因和信號傳導有關，487個基因和壓力和衰老有關。●特別適用于**甲基化研究。案例分析：用Agilent定制甲基化芯片和表達譜芯片共同篩選乳腺*患者的高甲基化基因，并探討甲基化與基因表達的關系為了尋找乳腺*早期診斷的甲基化標記基因，探討基因甲基化水平與基因表達量之間的關系，科研者使用甲基化芯片和表達譜芯片進行了相關研究。研究中，甲基化程度檢測使用BSP法和COBRA分析，基因表達水平檢測用RT-PCR。結果，在乳腺*患者中檢測到70對高度甲基化差異***的基因，表達譜芯片分析結果顯示在乳腺*患者中這70個基因大部分不表達；RT-PCR結果也顯示大部分基因表達量很低甚至不表達。這種研究策略，能夠直觀方便的篩查患者甲基化基因，有效地尋找乳腺*標記基因，對研究甲基化基因調控基因表達提供研究基礎。cfDNA，cell free DNA，就是血液中游離的自身DNA。安徽TAB-SeqDNA甲基化怎么樣

全基因組甲基化分析及特異位點甲基化檢測。陜西RRBSDNA甲基化經驗豐富

雖然焦磷酸測序可以進行單個位點甲基化程度的精確定量，但是目前來看，測序的片段長度還比較短，只有一百多bp，其中有效長度約為60bp。以上是對幾種常用的特異位點甲基化檢測方法進行了介紹及比較，還有一些檢測技術是在常用的檢測手段上進行優化或者將不同的方法進行結合應用，比如以MSP方法為基礎，發展了SMART-MSP技術，該技術利用定量技術對MSP擴增過程進行檢測，同時后續結合HRM技術來分析甲基化差異。此外，利用質譜平臺進行甲基化檢測的有MALDI-TOF技術，可以對甲基化進行精確檢測并能進行高通量篩選。從對這些技術的比較分析來看，沒中檢測技術都有各自的優點，并也存在一定的局限性，研究者可以根據自己的實際研究情況進行選擇。在特異甲基化位點檢測上，能夠提供BSP、HRM及焦磷酸測序三種技術的完整的檢測服務，具有豐富的經驗，幫助客戶加速甲基化研究進程。陜西RRBSDNA甲基化經驗豐富