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廣西歐易生物空間轉錄組報價

來源: 發布時間:2021-11-23

1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數據的技術,從而解析單個組織切片中的所有mRNA??臻g轉錄組的條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序,均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息,為研究和診斷提供有效數據支撐。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發育、神經和病理等研究方向。Science發表了將組織擴展和原位RNA測序結合起來的新型空間轉錄組技術ExSeq。廣西歐易生物空間轉錄組報價

第二,數據庫的建立。盡管當前空間轉錄組的數據在快速地增長,但尚未有對應的數據庫來對這些數據進行匯總集成。第三,研究物種及組織的多樣化。在當前時代,除 LCM 之外,研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉錄組學研究相對滯后。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術現代化,將為開發有用的空間轉錄組學地圖集提供廣闊的前景。第四,集成度高、交互性強、易擴展、文檔信息完善的開源工作流程的開發。該類工具的開發將簡化不同類型空間轉錄組學數據的整合和分析。青海歐易生物空間轉錄組有什么用研究通過對 ALS 小鼠疾病進程(癥狀前、發病、癥狀期和終末期)的脊髓組織進行空間轉錄組測序。

 空間重構的計算策略:這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢,從單個細胞的大量轉錄組數據中重構細胞間的環境。然而,這些推論方法在某些情況下*呈現空間趨勢或特定組織的總體布局?;贚CM的方法:基于LCM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組,盡管其通量很低,但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前,將少量細胞的數據粗略地整合到構成***的巨大背景中,可能具有一定價值。基于圖像的原位轉錄組學:基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區域,但也存在一些問題,例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞。空間條形碼加高通量:費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。

1. 空間轉錄組實驗步驟A。切片制備和優化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優化確定切片是否覆蓋靶向區域??臻g轉錄組實驗步驟B。切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的 mRNA 得到釋放,并結合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息??臻g轉錄組實驗步驟c。逆轉和文庫構建:以捕獲的 RNA 為模板,進行 cDNA 合成,和測序文庫制備??臻g轉錄組實驗步驟d。高通量上機測序:對制備好的測序文庫,進行二代高通量短讀長測序。空間轉錄組實驗步驟e。數據可視化分析:結合HE結果,確定哪些基因有表達,表達量高低,以及這些基因的空間位置信息??臻g轉錄組是一項前沿技術,涉及到很多細節方面的準備工作。

許多當前時代空間轉錄組技術的基礎都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。例如,于1976 年首先使用紫外線激光來切割組織。當前流行的技術,例如空間轉錄組學(ST)和 10X Visium 依靠這種微陣列技術,區別就在于是從放置在微陣列載玻片上的組織上而不是從溶液中來捕獲轉錄本信息。當前時代的空間轉錄組技術大致分為五類方向:激光顯微切割(LCM),單分子熒光原位雜交(smFISH),靶向原位測序(ISS),原位陣列捕獲和 其他非成像技術。空間轉錄組使得我們在檢測基因表達的同時獲得基因在組織內部的空間位置信息。北京空間轉錄組規格

許多當前時代空間轉錄組技術的基礎都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。廣西歐易生物空間轉錄組報價

空間轉錄組的應用有哪些?一、發現疾病的空間異質性:同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉錄組學問題。在不同的環境下,明智地選擇這些方法在生物學研究中也是至關重要的,例如在神經科學中,基于FISH的方法很普遍;基于LCM的方法適用于小樣本(例如臨床樣本)以及整個轉錄組或基因組分析。二、構建空間轉錄組圖譜:借助于空間分辨的單細胞轉錄組學,建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術,得到多個***的時空轉錄組圖譜(相關研究后續會在如下專輯更新)。廣西歐易生物空間轉錄組報價

上海歐易生物醫學科技有限公司位于聯航路1188號25幢,擁有一支專業的技術團隊。致力于創造***的產品與服務,以誠信、敬業、進取為宗旨,以建歐易生物產品為目標,努力打造成為同行業中具有影響力的企業。我公司擁有強大的技術實力,多年來一直專注于檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫藥產品、生化產品的研發,醫藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品)的研發、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業管理咨詢。的發展和創新,打造高指標產品和服務。自公司成立以來,一直秉承“以質量求生存,以信譽求發展”的經營理念,始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,為客戶提供良好的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢,從而使公司不斷發展壯大。

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