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來源: 發布時間:2023-04-26

采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發生***改變(2201個下調,1548個上調),560個基因(430個下調,130個上調)因攝入AL而發生***改變(圖3B)。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個(約占總鑒定蛋白質的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質發生***變化(109個上調,121個下調),AL處理有211個蛋白質發生***變化(116個上調,95個下調)。蛋白質是生命所必需的,具有結構、代謝、運輸、免疫、信號和調節等許多作用。內蒙古做蛋白組學哪家公司比較好

作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發育過程中蛋白質表達的定量比較,同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性,以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的,作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。內蒙古tmt蛋白組學標記試劑盒蛋白質組學-選歐易生物-專注蛋白質量檢測-高效快捷。

TMTpro-16plex等標記試劑已經發布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復、3組6重復的實驗設計,16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質譜儀平臺的蛋白組學近年來備受青睞,穩定同位素標記策略也被廣泛應用于多重定量蛋白質組學中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標記蛋白組,18個樣本以內,可實現一次標記和分級,避免了多批次標記引入的批次效應,能***提升樣本的數據質量。同時對更多蛋白質鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個技術可謂是2021年的又一創新技術。

綜上所述,本研究應用RNA-seq轉錄組分析結合iTRAQ蛋白質組學技術,探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態變化。此外,作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調控機制。許多功能轉錄本(16530)和蛋白質物種(1228)的模式發生了***變化,其中317個DAPs被轉錄組結果覆蓋。結合結構基因(蛋白)或轉錄因子的表達譜及相應化合物的含量,對重要代謝產物的調控網絡進行了探討。結果表明,黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。隨著蛋白質組學技術的發展,蛋白質組學數據分析的方法也將同樣快速發展。

本文為中國科學院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發表了的文章,通過iTRAQ標記定量蛋白質組學研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風險。從而將產生重大的經濟和生態影響,因此本研究結果具有重要的指導意義。在本研究中,研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水(約2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌進行***處理,以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白質組學方法,對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進行了研究,以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程。蛋白質組學研究涉及給定細胞、組織和/或生物體的整個蛋白質譜的分離、鑒定、定性、定量和功能表征。安徽rpms蛋白組學

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蛋白組學技術可以提供細胞狀態和調控的功能信息,本研究建立了單細胞蛋白組學方法,實現了高靈敏度的蛋白組學檢測。該技術有助于揭示疾病的發病機制,探討預后和風險相關的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學異質性和獨特的蛋白標志物,為藥物靶點***提供希望。大規模單細胞分析對于捕獲復雜細胞系統中的生物異質性至關重要,但*基于RNA技術的單細胞轉錄組學數據并不能很好地**蛋白質水平上的變化。而單細胞蛋白組學技術能夠從蛋白質水平上破譯細胞機制并且獲得更多的信息。內蒙古做蛋白組學哪家公司比較好

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