微生物16S rRNA測序+代謝組學研究：標題：EphB6缺陷小鼠的腸道菌群通過介導維生素B6動態平衡調節孤獨癥行為期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*樣本類型：小鼠糞便、腦組織*檢測平臺：LC-MS非靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測自閉癥譜系障礙（ASD）是一種發育障礙，目前對孤獨癥的**癥狀的有效***很有限。ASD患者臨床研究證據表明，腸道菌群與ASD發展之間存在聯系，但腸道菌群與ASD的腦功能障礙（腸腦軸）聯系機制尚未完全闡明。在腸道穩態起著重要作用的EphB6基因（位于7q號染色體，屬于受體酪氨酸激酶Eph家族），因基因突變和在ASD患者中表達下調，被認為是ASD的候選基因。但尚不清楚EphB6在調節腸道菌群和ASD發生的作用機制。本研究中作者發現EphB6在功能上與ASD相關，并通過腸道菌群介導的維生素B6和多巴胺，調節患者自閉癥樣行為。作者建立了EphB6缺陷小鼠腸道菌群失調與內側前額葉皮層（mPFC）（關鍵的腸腦功能軸）的興奮/抑制失衡之間的功能聯系。非靶向代謝組學 土壤非靶向代謝組學 脂質組學研究。上海中藥代謝組學定義
雙平臺代謝組學研究，2022年02月，中國中醫科學院廣安門醫院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，發現了***通絡方可有效地防治糖尿病并發癥形成與發展，探究了***通絡方防治糖尿病視網膜病變的作用機制，***通絡方可改善糖尿病大鼠視網膜組織病理損害；提高視網膜緊密連接蛋白，保護血-視網膜屏障；抑制p38MAPK相關通路及IncRNA MALAT1水平；降低全身及局部視網膜的炎癥及氧化應激水平。為***通絡方防治糖尿病視網膜病變提供了實驗依據。LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學主要用于***的中藥成分分析。江蘇代謝組學特征代謝組學,代謝組數據庫,代謝組分析,基因檢測。
高通量代謝組學研究,中文標題：高通量代謝組學方法發現***羊藿提取物對骨質疏松癥影響的代謝生物標志物及途徑發表期刊：Frontiersinpharmacology影響因子：5.810發表時間：2020年8月發表單位：南昌大學***附屬醫院運用組學技術：超高效液相色譜法結合四極桿飛行時間質譜法技術（UPLC-Q-TOF/MS）代謝組學。本研究采用UPLC-Q-TOF/MS代謝組學對OP模型中的大鼠和不同劑量Ext-epi處理的大鼠進行分析，從大鼠血清代謝組學和標志物相關代謝途徑中揭示了46種潛在生物。不同劑量組的Ext-epi對16種潛在的生物標志物具有***的逆轉作用，涉及三種主要的代謝途徑，其中ZL-IL的***效果相對穩定，組間聚類比較明顯，該劑量可被視為進一步研究的更好劑量。本研究從代謝組學水平評估了Ext-epi對OP的預防和***效果，為開發Ext-epi***OP提供了依據，也為開發OP***提取物提供了參考。
微生物組和代謝組學結果表明，高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調節消化和粘膜相關的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中，喂養含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結果，因為其共生細菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸鹽的增加以及促炎細胞因子的減少。代謝組學結果顯示盲腸組織的代謝特征發生了改變，包括脂質肉堿和α-生育酚等代謝物的上調和下調。這些發現為直鏈淀粉/支鏈淀粉的比例是如何通過調節微生物發酵，導致共生微生物群和代謝物的增殖，從而改善斷奶山羊的盲腸環境提供了新的見解。本篇文章，檢測了喂食不同直鏈淀粉/支鏈淀粉比例的山羊的盲腸中SCFAs和炎癥因子的變化，并使用16s RNA測序檢測了不同組山羊的盲腸粘膜和消化物中微生物的變化，找到了變化的優勢菌群以及菌群和SCFAs的相關性。再使用LC-MS/MS非靶代謝組學研究了不同組山羊盲腸組織的代謝物變化。通過多組學結合的方式，揭示了不同比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉對山羊盲腸環境的影響。代謝組學 研究一站式服務平臺-專業代謝組學研究。
代謝組學等多組學研究，2021年12月30日復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫院**教授課題組合作在Cancer Cell上發表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。代謝組學、空間代謝組學多組學聯合分析服務。江蘇現代代謝組學
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糞便代謝組分析，中文標題：二烯丙基二硫化物(DADS)通過調節腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象：小鼠糞便發表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子：5.293發表時間：2022年1月7日合作單位：復旦大學上海市第五人民醫院創傷急危重癥醫學科運用生物技術：糞便代謝組分析（由鹿明生物提供技術支持）、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導的腸道白色念珠菌小鼠模型，模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結腸炎的嚴重程度，另一方面通過微生物組學和代謝組學等手段確認了 DADS ***可以改善腸道生態失調（改變腸道微生物群和代謝物）、腸道通透性和全身炎癥反應。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。上海中藥代謝組學定義
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