代謝組學研究：浙江省農科院農產品質量營養所風險評估研究團隊聯合浙江工業大學在農藥聯合暴露效應機制研究中取得新進展，作者：楊桂玲，王彥華，李健，王豆，鮑志偉，王強（通訊作者），靳遠詳（共同通訊作者），在Journal of Hazardous Materials期刊發表了題為“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果，通過代謝組學+轉錄組學的多組學整合分析技術來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發育階段的復雜病理生理和毒性通路。靶向代謝組學、非靶向代謝組學在線咨詢。北京什么是代謝組學
尿液代謝組學研究案例，空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析，其中GC-MS檢測102種代謝物，LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節性，結果表明性別和季節對本研究的結果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明，Pu1和Po1之間的差異代謝物數量大于Po1和C之間的差異，LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物，體現出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物，使用綜合分析獲得候選差異代謝物，其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物，確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物，包括8種脂質、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明，***富集到5種代謝通路，與免疫、炎癥、人類的環境壓力、缺血和缺氧有關。上海代謝組學代謝通路的富集分析代謝組學——研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。
雙平臺代謝組學研究，2022年02月，中國中醫科學院廣安門醫院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，發現了***通絡方可有效地防治糖尿病并發癥形成與發展，探究了***通絡方防治糖尿病視網膜病變的作用機制，***通絡方可改善糖尿病大鼠視網膜組織病理損害；提高視網膜緊密連接蛋白，保護血-視網膜屏障；抑制p38MAPK相關通路及IncRNA MALAT1水平；降低全身及局部視網膜的炎癥及氧化應激水平。為***通絡方防治糖尿病視網膜病變提供了實驗依據。LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學主要用于***的中藥成分分析。
微生物組和代謝組學結果表明，高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調節消化和粘膜相關的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中，喂養含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結果，因為其共生細菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸鹽的增加以及促炎細胞因子的減少。代謝組學結果顯示盲腸組織的代謝特征發生了改變，包括脂質肉堿和α-生育酚等代謝物的上調和下調。這些發現為直鏈淀粉/支鏈淀粉的比例是如何通過調節微生物發酵，導致共生微生物群和代謝物的增殖，從而改善斷奶山羊的盲腸環境提供了新的見解。本篇文章，檢測了喂食不同直鏈淀粉/支鏈淀粉比例的山羊的盲腸中SCFAs和炎癥因子的變化，并使用16s RNA測序檢測了不同組山羊的盲腸粘膜和消化物中微生物的變化，找到了變化的優勢菌群以及菌群和SCFAs的相關性。再使用LC-MS/MS非靶代謝組學研究了不同組山羊盲腸組織的代謝物變化。通過多組學結合的方式，揭示了不同比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉對山羊盲腸環境的影響。基于 LC-MS/GC-MS代謝組學 從樣本采集到數據分析。
糞便LC-MS代謝組學研究方法，2022年，復旦大學上海市第五人民醫院創傷急危重癥醫學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法，發現了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***，并改變了小鼠腸道微生物群落結構和代謝特征，探究了DADS可以調節腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內在機理，為***白色念珠菌***提供了理論依據。歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學研究。上海血清 血漿做代謝組學
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代謝組學研究，2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質組學和代謝組學研究方法，發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征，探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸，為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。北京什么是代謝組學
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