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江西定量蛋白組學技術測什么

來源: 發(fā)布時間:2022-11-04

蛋白組學技術是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。DIA作為一種新的質譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學技術已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學技術分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達譜。蛋白表達的相關性圖顯示組內相關性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質組學通過研究生物樣本中蛋白質組成和變化,從而推動疾病的病理機制研究,為臨床診斷和預后提供潛在生物標志物。蛋白質組與代謝組聯(lián)合分析。江西定量蛋白組學技術測什么

iTRAQ蛋白質組學研究實用案例:2021年8月,浙江大學藥學院何俏軍、羅沛華團隊在Autophagy期刊發(fā)表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通過動物模型、功能實驗、iTRAQ蛋白質組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)了舒尼替尼誘導的自噬導致心肌細胞凋亡和心臟功能障礙,探究了舒尼替尼誘導的適應不良自噬通過TOLLIP介導的內體相關通路選擇性降解心肌細胞存活介質CCN2的機理,揭示了調節(jié)心肌細胞死亡的自噬降解新靶標蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據(jù)。中文標題:CCN2的自噬降解導致舒尼替尼的心臟毒性研究對象:小鼠發(fā)表期刊:Autophagy影響因子:16.016發(fā)表時間:2021年8月合作單位:浙江大學藥學院運用生物技術:iTRAQ蛋白質組學(由鹿明生物提供技術支持)安徽蛋白組學質譜分析蛋白質組學,修飾蛋白質組,蛋白·修飾·代謝。

作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發(fā)育過程中蛋白質表達的定量比較,同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性,以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現(xiàn)的,作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。

蛋白組學研究實用案例:東南大學醫(yī)學院院長劉必成教授領導的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果,通過蛋白組學+多層組學研究方法,建立IL-10細胞囊泡高表達模型的構建,提出并驗證了IL-10細胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說,探究了IL-10細胞外囊泡作為新型納米藥物的機理。中文標題:細胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向:新藥研發(fā)及其機制研究發(fā)表期刊:Scienceadvances影響因子:14.136發(fā)表單位:中國南京東南大學附屬中大醫(yī)院腎內科運用生物技術:LC-MS/MS蛋白組學(由鹿明生物提供技術支持)靶向蛋白質組學,信號通路蛋白靶點高通量分析。

2021年10月,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質蛋白表達下調,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉錄組學和蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持。歐易鹿明生物基于質譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質組學。安徽蛋白組學質譜分析

定量蛋白質組學 蛋白質進行質譜檢測未知蛋白進行全檢測。江西定量蛋白組學技術測什么

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題:氮調節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質水平調節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農業(yè)大學運用生物技術:TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數(shù)據(jù)探索了調節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。江西定量蛋白組學技術測什么

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