轉錄組學和蛋白質組學分析作者通過轉錄組學和蛋白質組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因（DEG）。轉錄組學鑒定了2387個DEG，其中72%被下調。蛋白質組學鑒定出402個DEG，其中74%被下調。GO和KEGG通路富集分析表明，轉錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調節”等生物學過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質消化吸收”。蛋白質組學分析中，富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質轉運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”、“細胞外基質”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質消化和吸收”。前兩條通路與上調的DEG相關，而后兩條通路與下調的DEG相關，這與轉錄組學結果一致。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統Label free蛋白組學區別在哪。福建定量磷酸化蛋白組學
3篇經典的蛋白組學和代謝組學在水產動物中的研究。水產動物的研究不僅是保障我國海水養殖業的健康可持續發展，同時可為良種創制、海洋環境研究、生態研究等提供重要理論基礎和技術支撐~因此在水產生物研究方面蛋白組學、代謝組學在其中起到什么作用呢？期望這3篇經典文章能給您思路~中文標題：CO2誘導的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細胞和蛋白質組學的綜合研究研究對象：牡蠣發表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：6.551合作單位：中國科學院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術：iTRAQ標記定量蛋白質組學（由鹿明生物提供技術支持）福建代謝組學和蛋白組學費用蛋白組學常見研究模式 | 蛋白質組專題_鹿明生物。
iTRAQ蛋白質組學研究實用案例：2021年8月，浙江大學藥學院何俏軍、羅沛華團隊在Autophagy期刊發表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果，通過動物模型、功能實驗、iTRAQ蛋白質組學等研究方法，發現了舒尼替尼誘導的自噬導致心肌細胞凋亡和心臟功能障礙，探究了舒尼替尼誘導的適應不良自噬通過TOLLIP介導的內體相關通路選擇性降解心肌細胞存活介質CCN2的機理，揭示了調節心肌細胞死亡的自噬降解新靶標蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據。中文標題：CCN2的自噬降解導致舒尼替尼的心臟毒性研究對象：小鼠發表期刊：Autophagy影響因子：16.016發表時間：2021年8月合作單位：浙江大學藥學院運用生物技術：iTRAQ蛋白質組學(由鹿明生物提供技術支持)
DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發病率低，表現形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫藥大學課題組在J Proteomics.期刊發表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學研究方法，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標志物。同時作者發現補體系統抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調，這可能在SAPHO綜合征的發病機制中發揮重要作用。蛋白質組學,修飾蛋白質組,蛋白·修飾·代謝。
采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發生***改變（2201個下調，1548個上調），560個基因（430個下調，130個上調）因攝入AL而發生***改變（圖3B）。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個（約占總鑒定蛋白質的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質發生***變化（109個上調，121個下調），AL處理有211個蛋白質發生***變化（116個上調，95個下調）。一站式服務,研究不同生物體在不同時刻/狀態下蛋白質表達的變化。天津蛋白組學ppt
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TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫藥大學附屬醫院江蘇省中醫院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法，發現了糖尿病腎病（DKD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標志物。為優化糖尿病腎病（DKD）管理提供了豐富且開放訪問的數據資源。中文標題：血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫院運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術支持)、ELISA福建定量磷酸化蛋白組學
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