GC-MS非靶向代謝組，標題：銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊：EnvironmentalScience&Technology影響因子：9.028發表時間：2020年2月合作單位：南京大學環境學院運用生物技術：16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組（由鹿明生物提供技術支持）。銀納米顆粒（AgNPs）是使用*****的工程納米材料之一，泄露可能導致顆粒在土壤中積累，并對環境造成未知風險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產生***影響，但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征，但當前有關NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關信息，鑒于它們的已知功能，人們可以對土壤生物化學的變化提出合理假設。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學方法，研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響。代謝組學專區 系統生物學驅動的功能代謝組學方法,具有高靈敏、高分辨和高通量。江蘇非靶向代謝組學檢測
本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法，對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析，分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物，結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態變化，采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物，發現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平，這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關；而生物氣溶膠劑則通過***系統對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物；4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物，可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。浙江流式細胞 代謝組學非靶向代謝組學 土壤非靶代謝學 非靶脂質組學研究。
雙平臺代謝組學研究，2022年02月，中國中醫科學院廣安門醫院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，發現了***通絡方可有效地防治糖尿病并發癥形成與發展，探究了***通絡方防治糖尿病視網膜病變的作用機制，***通絡方可改善糖尿病大鼠視網膜組織病理損害；提高視網膜緊密連接蛋白，保護血-視網膜屏障；抑制p38MAPK相關通路及IncRNA MALAT1水平；降低全身及局部視網膜的炎癥及氧化應激水平。為***通絡方防治糖尿病視網膜病變提供了實驗依據。LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學主要用于***的中藥成分分析。
代謝組學研究：濃香型白酒（SFB）在窖泥窖內發酵過程中，獲得了其特有的風味。窖泥中的微生物是產生風味酯的關鍵前提物。本篇為歐易/鹿明生物合作客戶四川省農業科學院水稻高粱研究所（一作：劉茂柯）于2020年3月在微生物學專刊《mSystems》（IF=6.469）發表的題為“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究報道，該研究對釀造微生態系統進行了***16S rRNA測序，蛋白質組學和代謝組學聯合分析。運用多組學方法能夠更***地了解高質量濃香白酒生產過程中人工窖泥微生物群落發生的代謝過程變化，這將有助于進一步優化人工窖泥培養技術和改善濃香白酒的質量。非靶向代謝組學 土壤非靶向代謝組學 脂質組學研究。
代謝組學數據提供了COVID-19患者各階段循環代謝物特征的綜合觀點，并確定了葡萄糖代謝和尿素循環的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段，靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中，發現隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰，負離子模式631個、正離子模式下的1835個；通過篩選，鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合，而重癥組和恢復組很容易區分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D)；與正常組對比，***上調的代謝物：輕癥組有48個，嚴重組有59個，恢復組有64個；***下調的代謝物：輕癥組有33個，重癥組有29個，恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析；首先根據發現隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除)；定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度，將199個代謝物分為16個簇；然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。代謝組學分析價格-歐易生物特色研究-多項目經驗-自有實驗室代謝組學。江蘇代謝組學主成分分析
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代謝組學+轉錄組學研究：2022年2月，中國海洋大學食品科學與工程學院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通過轉錄組學和代謝組學等研究方法，發現植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導的群體感應(QS)系統來調節其生長特性和代謝，該系統是參與食品安全的正調控因子，這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護控制潛力，特別是在食品工業生物技術中的應用。江蘇非靶向代謝組學檢測
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