4D蛋白組學：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續碎裂（PASEF）數據采集模式兩大創新技術，可實現快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質組學分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現蛋白深度覆蓋，結果更精細，也成為轉化組學應用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊列項目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。蛋白組學研究組織,血液,植物,尿液,動物,細胞樣品,酵母,微生物.。北京蛋白組學測試
蛋白組學研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫藥大學教育部中醫養生學重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法，發現了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理。為預防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據。浙江蛋白組學的結果蛋白組學專業客服在線為您答疑 。
作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發育過程中蛋白質表達的定量比較，同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性，以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的，作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。
蛋白質組數據分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達，兩種化學物質對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結果與蛋白質組變化相一致，這進一步證實了蛋白質組學數據中蛋白質的表達（圖4B）。轉錄組學和蛋白質組學聯合分析結果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。一站式服務,研究不同生物體在不同時刻/狀態下蛋白質表達的變化。
綜上所述，本研究應用RNA-seq轉錄組分析結合iTRAQ蛋白質組學技術，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調控機制。許多功能轉錄本(16530)和蛋白質物種(1228)的模式發生了***變化，其中317個DAPs被轉錄組結果覆蓋。結合結構基因(蛋白)或轉錄因子的表達譜及相應化合物的含量，對重要代謝產物的調控網絡進行了探討。結果表明，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。單細胞蛋白質組學，極微量樣本檢測。遼寧代謝組學與蛋白組學
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蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學研究案例：2021年12月30日復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫院**教授課題組合作在Cancer Cell上發表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。北京蛋白組學測試
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