蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學研究案例：2021年12月30日復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫院**教授課題組合作在Cancer Cell上發表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。研究機構,提供蛋白組學聯合分析,技術咨詢服務。江西蛋白組學
采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析，共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析，結果顯示，不同組間樣品具有很好的區分，每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中，198個（32%）和198個（26%）蛋白質豐度增加，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個蛋白質的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。江西蛋白組學服務蛋白組學檢測一個樣多少錢。
蛋白質是生命活動的主要執行者，而蛋白質磷酸化修飾是生物體內**重要的共價修飾方式之一，真核生物體內有超過三分之一的蛋白可以發生磷酸化修飾。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及**發生等過程在內的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質組學只能解釋蛋白磷酸化水平發生的變化，而[黃金搭檔]——蛋白質組與磷酸化蛋白質組聯合分析，則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發揮了更加重要的作用。
通過蛋白質組學分析檢測了經M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達的功能基因，包括與炎癥、細胞增殖、免疫調節和血管生成相關的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標記基因的上調與炎癥因子IL3RA有關，增殖相關蛋白CD40和免疫調節因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進人腦微血管內皮細胞的血管生成能力，因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關基因的表達。蛋白質印跡結果顯示血管生成相關基因FlK1和ANGPT1的表達明顯增強(圖2I)。綜上所述，結果證實了M-Exos誘導了人腦微血管內皮細胞的功能改變。靶向蛋白質組學，信號通路蛋白靶點高通量分析。
本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關鍵候選基因和蛋白質的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據。中文標題：基于iTRAQ蛋白質組學和轉錄組學聯合分析揭示油茶種子成熟過程中油質相關的關鍵代謝產物的積累研究對象：油茶種子發表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發表時間：2021.07.01發表單位：海南大學園藝園林學院運用生物技術：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持走近蛋白組學之蛋白組學常見問題答疑解惑。遼寧蛋白組學 價格 大概多少錢
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采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發生***改變（2201個下調，1548個上調），560個基因（430個下調，130個上調）因攝入AL而發生***改變（圖3B）。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個（約占總鑒定蛋白質的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質發生***變化（109個上調，121個下調），AL處理有211個蛋白質發生***變化（116個上調，95個下調）。江西蛋白組學
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