為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調節”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質”、“細胞外區域”和“蛋白質細胞外基質”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。蛋白組學技術對腎錯構瘤尿液差異蛋白的研究。上海蛋白組學是幾代測序
2022年2月，亞特蘭大埃默里大學醫學院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果，通過基因組學、轉錄組學、TMT標記定量蛋白質組學、代謝組學的研究方法，揭示了新的與AD相關的蛋白共表達模塊，部分模塊在RNA的網絡中不存在。這為開發疾病***的潛在靶點提供依據，為臨床的蛋白質組研究提供重要價值。上海itraq 蛋白組學蛋白組學檢測一個樣多少錢。
為了確定TMT AD蛋白網絡模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區域，使用 TMT標記定量蛋白質組學多個隊列的所有組織，為每個隊列生成蛋白質共表達網絡，并評估了 AD 網絡模塊是否保留在每個隊列和大腦區域中。發現幾乎所有的 TMT AD 網絡模塊都保留在隊列和大腦區域（圖2b）。阿爾茨海默病(AD)是一種神經系統退行性疾病，其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學方向出發，建立蛋白共表達網絡，綜合轉錄組學結果，解析疾病相關的蛋白組學模塊或能為AD提供可靠的生物標志物，并為治療帶來希望。
作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題：氮調節茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質水平調節研究對象：茶樹根發表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發表時間：2021年9月1日發表單位：安徽農業大學運用生物技術：TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數據分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數據探索了調節機制。本文的多組學數據整合分析思路值得借鑒。蛋白質組學-鹿明生物丨歐易生物。
蛋白質是生命活動的主要執行者，而蛋白質磷酸化修飾是生物體內**重要的共價修飾方式之一，真核生物體內有超過三分之一的蛋白可以發生磷酸化修飾。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及**發生等過程在內的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質組學只能解釋蛋白磷酸化水平發生的變化，而[黃金搭檔]——蛋白質組與磷酸化蛋白質組聯合分析，則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發揮了更加重要的作用。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統Label free蛋白組學區別在哪。江蘇蛋白組學的結果
歐易鹿明生物蛋白質研究技術。上海蛋白組學是幾代測序
為了驗證TMT蛋白組學數據，作者選擇了18個與蓮種胚脫水保護功能密切相關的候選DEPs進行PRM蛋白靶向驗證。PRM鑒定了18個候選DEPs。這些蛋白質的表達模式在PRM和TMT的定量結果之間顯示出類似的趨勢。然而，PRM檢測到的蛋白豐度的倍數變化值要大于TMT數據。這一結果在很大程度上支持了TMT數據的可靠性。基于TMT標記定量蛋白質組學的生物信息學分析，對脅迫生理指標進行了測定，以驗證蓮種胚脫水的保護機制。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反，它們的水平迅速增加（圖6A，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）。上上海蛋白組學是幾代測序
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