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來源: 發布時間:2022-06-14

GC-MS非靶向代謝組學yan'j2021年11月,上海交通大學醫學院附屬新華醫院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學和轉錄組學研究方法,發現了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發病機理。

中文標題:轉錄組學結合代謝組學揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學附屬新華醫院運用生物技術:GC-MS非靶向代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)、轉錄組學、qRT-PCR 非靶向代謝組學數據分析 靶向代謝組學數據分析。上海代謝組學多少錢

GC-MS代謝組學結果:通過GC-MS代謝組學觀察到 92種化合物,其中,49種與數據庫中可用的化合物相匹配,包括重要的發酵代謝物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和幾種 (n=10) 初級氨基酸。NMR也觀察到了七種已鑒定的化合物。通過 GC-MS 測量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸濃度隨溫度處理而變化,隨著溫度的升高,通常趨向于更高的糖濃度和更低的游離氨基酸濃度(圖 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一個明顯的例外,在濃度與溫度處理中觀察到了積極的趨勢(圖 3)。此外,與植物應激反應相關的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羥基-3-甲氧基苯甲酸)隨溫度升高而增加(SI 附錄,圖 S5)。上海血液代謝組學檢測對生物體內所有代謝物進行定量分析-代謝組學。

LC-MS非靶向代謝組學,中文標題:TNT、RDX、HMX(三種物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性機制分析研究對象:苜蓿根發表期刊:Chemosphere影響因子:7.086發表時間:2021.05.18合作單位:西南科技大學運用關鍵技術:LC-MS非靶向代謝組學文章中LC-MS非靶向代謝組學由歐易/鹿明生物提供技術支持2021年5月,西南科技大學羅學剛教授團隊在Chemosphere期刊發表的研究成果,通過LC-MS非靶向代謝組學研究方法,探索了物暴露對植物的毒性機制,驗證了植物體內被降解的TNT、RDX和HMX殘留物和中間產物干擾植物正常生理代謝的假設。描繪了在三種物影響下苜蓿代謝組圖譜,為環境污染物毒理學研究提供了新思路和方法。

代謝組學研究,2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過蛋白質組學和代謝組學研究方法,發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征,探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸,為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。上海 -代謝組學-提供高效檢測分析服務。

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。代謝組學 尋找代謝物與生理病理的研究方式。北京血漿代謝組學

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LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目:糞便微生物可以區分酒精性肝炎引起的酒精攝入量,但不能區分疾病的嚴重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*樣本類型:人糞便*檢測平臺:LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表征酒精性肝炎有關的糞便微生物生態學,考察微生物組變化和疾病嚴重程度的關系,推斷微生物生態學變化的功能相關性,本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的糞便微生物組與健康(HC)和重度飲酒對照組(HDC)進行比較,通過16SrRNA基因測序鑒定微生物群分類,使用LC/MS平臺測量糞便短鏈脂肪酸(SCFA)含量。重度飲酒患者與健康對照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比,均可以發現明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,糞便中短鏈脂肪酸與產生SCFA的微生物菌群均減少,可以推斷出,酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化,與酒精性肝炎的嚴重程度無關。上海代謝組學多少錢

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