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遼寧蛋白組學標本要求

來源: 發布時間:2022-06-09

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題:氮調節茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質水平調節研究對象:茶樹根發表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發表時間:2021年9月1日發表單位:安徽農業大學運用生物技術:TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數據分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數據探索了調節機制。本文的多組學數據整合分析思路值得借鑒。蛋白質組學生物標志物&機制研究一站式服務。遼寧蛋白組學標本要求

在本研究中,利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發育的4個時間點采樣進行蛋白質組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發育過程中,轉錄本和蛋白質組之間存在相當大的時序一致性。在四個發育時期中,花后70天(種子發育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發育的關鍵時期:在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值,同時種仁內部大部分營養物質開始迅速積累。通過轉錄組數據和蛋白質組數據綜合分析油脂合成的調控網絡,乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。江蘇研究蛋白組學的方法蛋白驗證新技術-PRM,平行反應監視蛋白組學。

采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發生***改變(2201個下調,1548個上調),560個基因(430個下調,130個上調)因攝入AL而發生***改變(圖3B)。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個(約占總鑒定蛋白質的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質發生***變化(109個上調,121個下調),AL處理有211個蛋白質發生***變化(116個上調,95個下調)。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術鑒定AHSG和RPL29分別是上調和下調*****的蛋白。301份肝*標本的統計分析表明AHSG與NMT1呈正相關,而RPL29與NMT1呈負相關(圖8A)。此外,NMT1和AHSG均與**分期正相關,而RPL29與肝*的**分期呈負相關(圖8B)。值得注意的是,NMT1和AHSG水平較高的肝*患者的生存率低于水平較低的肝*患者(圖8C)。而較高水平的RPL29表明存活率較高(圖8C)。這些數據表明NMT1、NUP和NDP與肝*的臨床結果密切相關。iTRAQ蛋白質組學技術鑒定NMT1敲除時發生變化的蛋白質;4D-蛋白組+代謝組雙平臺知識干貨帶您。

TMT標記定量蛋白質組學研究案例:2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過蛋白質組學和代謝組學研究方法,發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征,探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸,為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。中文標題:銅耗竭調節線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉移研究對象:高風險三陰性乳腺*(TNBC)發表期刊:NatureCommunications影響因子:14.919發表時間:2021年12月合作單位:紀念斯隆凱特琳**中心,Sandra和EdwardMeyer**中心運用關鍵生物技術:TMT標記定量蛋白質組學和靶向代謝組學蛋白質組學,蛋白質組分析,專業的多組學聯合分析。江蘇研究蛋白組學的方法

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