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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組聚焦于在單細(xì)胞層面,對(duì)細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,如信使RNA、非編碼RNA等進(jìn)行研究,借此繪制高分辨率基因表達(dá)譜,解析組織和分子層面的復(fù)雜性。它能精細(xì)揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性,展現(xiàn)細(xì)胞在不同生理、病理狀態(tài)下的基因表達(dá)差異,為深入了解細(xì)胞功能、發(fā)育過程、疾病機(jī)制等提供關(guān)鍵線索,助力科研人員突破傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄組研究局限,從單細(xì)胞維度探尋生命奧秘。上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組業(yè)務(wù)方面表現(xiàn)。公司運(yùn)用先進(jìn)的10×genomics技術(shù),可一次性高效分離500-10000個(gè)細(xì)胞,將單個(gè)細(xì)胞內(nèi)微量mRNA經(jīng)高效擴(kuò)增后測(cè)序。盡管該技術(shù)對(duì)RNA質(zhì)量要求高,RNA降解會(huì)導(dǎo)致5’端信息缺失,且能測(cè)3'端一小段序列,但在細(xì)胞數(shù)量獲取及后續(xù)分析上優(yōu)勢(shì)。在科研合作中,為瑞金、華山等數(shù)百家三甲醫(yī)院及高校提供從樣本處理、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序到數(shù)據(jù)分析的一站式服務(wù)。輔助客戶在《GUT》《AdvSci》等國際頂刊發(fā)表數(shù)十篇文章,以專業(yè)團(tuán)隊(duì)、自主研發(fā)的質(zhì)量控制體系及強(qiáng)大產(chǎn)業(yè)化服務(wù)能力,推動(dòng)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究在臨床科研等領(lǐng)域的深入應(yīng)用。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組可通過全基因組探針來監(jiān)測(cè)特定基因在不同細(xì)胞類型、不同發(fā)育階段或不同環(huán)境條件下的表達(dá)情況。河南單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組降維

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)是在單細(xì)胞層面研究轉(zhuǎn)錄組的前沿技術(shù)。其原理是先分離單個(gè)細(xì)胞,提取RNA并逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,經(jīng)文庫構(gòu)建與高通量測(cè)序,獲取細(xì)胞基因表達(dá)信息。技術(shù)流程包含多個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)。從單細(xì)胞的分離捕獲,如顯微操作、流式細(xì)胞術(shù)、微流控技術(shù)等方法,到RNA提取與逆轉(zhuǎn)錄、文庫構(gòu)建、測(cè)序,再到數(shù)據(jù)預(yù)處理、細(xì)胞聚類等數(shù)據(jù)分析步驟,每個(gè)環(huán)節(jié)都對(duì)結(jié)果準(zhǔn)確性至關(guān)重要。在應(yīng)用上,該技術(shù)成果豐碩。于發(fā)育生物學(xué)探究細(xì)胞分化軌跡,在研究中剖析細(xì)胞異質(zhì)性,于神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域揭示神經(jīng)元多樣性。盡管單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢(shì),能解析細(xì)胞異質(zhì)性、助力疾病研究,但也存在局限。它成本高昂,對(duì)實(shí)驗(yàn)與分析要求高,且單細(xì)胞RNA含量少,易出現(xiàn)丟失或降解問題,影響數(shù)據(jù)質(zhì)量。河南單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組降維單細(xì)胞技術(shù)使研究細(xì)胞間動(dòng)態(tài)相互作用成為可能。

上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司以單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)為技術(shù),聚焦細(xì)胞層面的精細(xì)基因表達(dá)解析,為生命科學(xué)研究和臨床轉(zhuǎn)化提供多維數(shù)據(jù)支撐。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的在于突破傳統(tǒng)測(cè)序的“細(xì)胞群體均值化”限制,通過微流控芯片或微孔板技術(shù)實(shí)現(xiàn)單個(gè)細(xì)胞的高效捕獲與標(biāo)記,結(jié)合分子條形碼(如10xGenomics的GemCode或BDRhapsody的分子標(biāo)簽)對(duì)每個(gè)細(xì)胞的mRNA進(jìn)行標(biāo)記。在逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA后,通過高通量測(cè)序及生物信息學(xué)算法(如Seurat、Monocle等),精確解析數(shù)千至上萬個(gè)單細(xì)胞的基因表達(dá)譜,構(gòu)建細(xì)胞類型注釋、亞群分化軌跡及功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò),揭示疾病發(fā)生、免疫響應(yīng)等過程的動(dòng)態(tài)機(jī)制。慕柏生物依托國際的測(cè)序平臺(tái)(如IlluminaNovaSeq6000)與自主優(yōu)化的濕實(shí)驗(yàn)流程,提升低質(zhì)量樣本(如FFPE組織、微量細(xì)胞)的建庫成功率,并開發(fā)了針對(duì)稀有細(xì)胞群(如循環(huán)細(xì)胞、干細(xì)胞)的特異性捕獲方案。在數(shù)據(jù)分析端,公司結(jié)合AI驅(qū)動(dòng)的算法模型(如細(xì)胞狀態(tài)預(yù)測(cè)、細(xì)胞間通訊分析),深度挖掘異質(zhì)性、微環(huán)境互作及耐藥性演化等關(guān)鍵科學(xué)問題。目前,慕柏生物已與多家三甲醫(yī)院及科研機(jī)構(gòu)合作,在神經(jīng)退行性疾病、發(fā)育圖譜構(gòu)建及CAR-T機(jī)制解析等領(lǐng)域取得突破性成果。
上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司依托單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù),為生命科學(xué)研究和臨床轉(zhuǎn)化提供細(xì)胞級(jí)精度的基因表達(dá)全景解析。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)通過解構(gòu)傳統(tǒng)測(cè)序中“細(xì)胞群體均值化”的盲區(qū),實(shí)現(xiàn)對(duì)單個(gè)細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組的檢測(cè),揭示細(xì)胞異質(zhì)性、稀有亞群及動(dòng)態(tài)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。其原理基于“單細(xì)胞分離—分子標(biāo)記—高通量測(cè)序”三大模塊:首先利用微流控分選(如10xGenomics)或微孔板技術(shù)(如BDRhapsody)將組織解離后的單細(xì)胞懸液逐一捕獲,并為每個(gè)細(xì)胞分配獨(dú)特的核酸條形碼(Barcode);隨后裂解細(xì)胞釋放mRNA,通過逆轉(zhuǎn)錄合成攜帶細(xì)胞標(biāo)簽的cDNA文庫,并引入分子標(biāo)識(shí)符(UMI)消除PCR擴(kuò)增偏差;借助Illumina等高通量測(cè)序平臺(tái),生成數(shù)千至上萬個(gè)單細(xì)胞的基因表達(dá)矩陣,結(jié)合AI驅(qū)動(dòng)的聚類算法(如t-SNE、UMAP)和擬時(shí)序分析(如Monocle3),繪制細(xì)胞類型圖譜、分化軌跡及功能互作網(wǎng)絡(luò),精細(xì)定位疾病相關(guān)關(guān)鍵細(xì)胞亞群。作為技術(shù),慕柏生物創(chuàng)新性整合單細(xì)胞多組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),突破單一維度的研究局限。針對(duì)臨床樣本的特殊性(如石蠟包埋組織、穿刺微量樣本),公司開發(fā)了低起始量RNA修復(fù)技術(shù),結(jié)合靶向探針富集策略,將檢測(cè)靈敏度提升至單細(xì)胞級(jí)別。解析細(xì)胞異質(zhì)性,打破群體測(cè)序平均化局限,準(zhǔn)確識(shí)別樣本中不同亞型細(xì)胞。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)是一種在單個(gè)細(xì)胞水平解析全基因表達(dá)譜的技術(shù),能夠精確揭示細(xì)胞異質(zhì)性、功能狀態(tài)及調(diào)控網(wǎng)絡(luò),突破傳統(tǒng)批量測(cè)序的均值化局限,為異質(zhì)性研究、免疫微環(huán)境解析、干細(xì)胞分化追蹤及疾病機(jī)制探索提供高分辨率數(shù)據(jù)支持。根據(jù)《自然》期刊研究,單細(xì)胞技術(shù)對(duì)稀有細(xì)胞亞群(如干細(xì)胞、循環(huán)細(xì)胞)的檢測(cè)靈敏度較傳統(tǒng)方法提升60%以上,推動(dòng)精細(xì)醫(yī)學(xué)發(fā)展。慕柏生物采用國際的10xGenomicsChromium平臺(tái),結(jié)合自主優(yōu)化的細(xì)胞捕獲與生信分析體系,單次實(shí)驗(yàn)可實(shí)現(xiàn)超8萬個(gè)細(xì)胞的高通量捕獲,覆蓋超,檢測(cè)數(shù)據(jù)經(jīng)中國合格評(píng)定國家認(rèn)可委員會(huì)(CNAS)認(rèn)證實(shí)驗(yàn)室質(zhì)控,嚴(yán)格遵循國際單細(xì)胞測(cè)序聯(lián)盟(ISAC)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。公司基于ISO15189醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室管理體系,聯(lián)合上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院等機(jī)構(gòu)構(gòu)建亞洲單細(xì)胞免疫圖譜數(shù)據(jù)庫(樣本量≥),檢測(cè)靈敏度達(dá),特異性(經(jīng)國家衛(wèi)健委臨床檢驗(yàn)中心室間質(zhì)評(píng)驗(yàn)證)。技術(shù)流程涵蓋細(xì)胞活性質(zhì)控(存活率≥95%)、低豐度基因檢測(cè)(檢測(cè)限)及多維度數(shù)據(jù)注釋(含50+功能通路分析),檢測(cè)報(bào)告由臨床病理與生物信息團(tuán)隊(duì)聯(lián)合簽發(fā),包含細(xì)胞亞群鑒定、分化軌跡預(yù)測(cè)及靶點(diǎn)推薦。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)經(jīng)國密算法加密存儲(chǔ)于國家超算中心。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)揭示細(xì)胞異質(zhì)性,推動(dòng)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)發(fā)展。河南單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組降維
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組有助于開發(fā)個(gè)性化的治療方案,推動(dòng)醫(yī)療的發(fā)展。河南單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組降維
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)打破傳統(tǒng)組織樣本研究的局限,從細(xì)胞個(gè)體層面揭示生物奧秘。傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄組學(xué)是對(duì)大量細(xì)胞的平均分析,掩蓋了細(xì)胞間差異,而單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能精細(xì)捕捉每個(gè)細(xì)胞的獨(dú)特基因表達(dá)譜,如同給細(xì)胞繪制“個(gè)性畫像”。這項(xiàng)技術(shù)的在于實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞層面的RNA測(cè)序。在實(shí)驗(yàn)中,借助先進(jìn)的單細(xì)胞分離與捕獲技術(shù),確保每個(gè)細(xì)胞分析,避免群體細(xì)胞間信號(hào)干擾。通過逆轉(zhuǎn)錄、文庫構(gòu)建與高通量測(cè)序,將細(xì)胞內(nèi)RNA信息轉(zhuǎn)化為可分析的數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)是解讀單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。運(yùn)用生物信息學(xué)算法,可對(duì)海量數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,識(shí)別出不同細(xì)胞亞群,還能通過擬時(shí)序分析,推斷細(xì)胞的發(fā)育軌跡或疾病進(jìn)展中的細(xì)胞變化過程。在生命科學(xué)研究與臨床應(yīng)用中,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)展現(xiàn)出巨大潛力。在免疫學(xué)研究中,可挖掘新型免疫細(xì)胞類群及其功能;在再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,助力了解干細(xì)胞分化機(jī)制;在疾病診斷方面,通過分析病變組織單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物,為個(gè)性化醫(yī)療提供依據(jù)。河南單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組降維