代謝組學比較常用到的數據分析方法：代謝組學分析數據用于統計分析時，數據集通常為一個N × K的矩陣（X矩陣），N表示N個樣本數，每一行表示一個樣品， K表示K個變量，每一列表示一個變量，在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量，不考慮多個變量的相互作用與內在聯系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數據對所測樣品的優劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數變化大小（Fold Change，FC）表示實驗組與對照組的含量比值，可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。相比于其他組學，代謝組學有哪些特殊的優勢？深圳靶向代謝組學服務

代謝組學細胞樣本收集：懸浮細胞：1）連同培養基轉移到1.5 mL的進口離心管中。2）低速離心5 min（低于3000 rpm），使細胞沉淀于離心管的底部（1*107個細胞為宜）。3）倒掉培養基（盡量倒干凈），用預冷的PBS反復沖洗2 ~ 3次，低速離心5 min，棄上清。4）標記離心管，將離心管的尖的一端插入液氮中，淬滅細胞沉淀1 min，-80 ℃凍存，干冰寄送。注意事項：1. 培養基傾倒時盡量倒干凈，可使用濾紙將殘留培養液吸凈；2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規格；3. 液氮淬滅細胞時，請小心避免離心管破碎導致樣本受損;4. 建議細胞樣本在進行培養時多準備樣本，以備后續使用。深圳靶向代謝組學服務在食品安全領域，利用代謝組學工具發現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。

代謝組學有哪些特點？(1) 代謝處于系統生物學的末端，更能反映基因與外部環境互作的真實情況，因此，在多數生物表型研究上更加適用。(2) 常規代謝組學只關注內源性化合物，也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內源性化合物的上調和下調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內源性化合物的結果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內在和外在因素影響下，生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。

代謝組學研究方法：代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰，然后了解不同化合物的結構，建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析（metabolomic profiling）,研究人員假定了一條特定的代謝途徑，并對此進行更深入的研究。代謝組學的代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數目。

代謝組學樣本收集植物組織：果實、種子：1）對于含水量高、體積較大的果實（番茄、西瓜、蘋果等）需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等)，可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3）對于要求對整個果實進行提取的（整粒葡萄等），需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min，-80 ℃凍存，干冰寄送。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。深圳靶向代謝組學服務

代謝組學的代謝產物是基因表達的產物。深圳靶向代謝組學服務

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