什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發生的一系列生物事件。與基因組學和蛋白質組學相比，代謝組學將在臨床上發揮更大的作用。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學
如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據？實驗設計先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質量數據，有以下幾個方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此，一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備，以減少人為的誤差。2）檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態。儀器的控制軟件都有系統自檢功能，可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態。但更重要的是氣相色譜狀態，推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前，先進行質控樣檢測，確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3）后期數據矯正，特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本（每個樣品取少量后混合），在后期數據處理時，使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。深圳常規靶向代謝組學應用什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學？
代謝組學在系統生物學中有什么作用？它的地位如何？代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現象揭示生命本質。代謝組學本質上是指從整體上研究生物體的代謝物，是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎，高通量檢測為手段，通過研究生物體內代謝物的種類與數量及其變化規律來闡述機體在正常生命狀態及環境變化后的代謝過程。代謝組是系統生物學的分支學科之一。其研究內容主要包括對代謝物進行定性或定量分析，不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究，不同生長環境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產物的應答，進行代謝途徑或代謝網絡解析與轉基因評價。
藥物代謝和代謝組學區別：代謝組學與藥物代謝不同是它關注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內源性代謝物。這些代謝物是糖，脂肪，蛋白質，核酸，膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的，是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比，發現潛在標志物，指導疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內變化就好，相當具有靶向性，因此使用的技術手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體，和具體的藥效，藥代動的效應。與基因組學和蛋白質組學相比， 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。
GC-MS非靶向代謝組學能檢測到哪些類別的代謝物？衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度？GC/MS的定性有雙重標準，一是保留指數，二是質譜信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的軟電離源，GC/MS使用的EI源屬于硬電離，能量較強且穩定，在將代謝物分子電離后，分子離子峰進一步碎裂產生豐富的碎片離子。因此，我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”，將儀器得到的實際指紋圖譜和質譜庫（如NIST庫）進行比對后，我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數和相似度都必須滿足設定的閾值，軟件才會給出色譜峰的定性結果。然后采用標準品質譜信息進行完全比對定性，也就是說只有經過標準品比對，代謝物才是被100%定性。代謝組學在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。深圳個性化定制靶向代謝組學分析鑒定
代謝組學是系統生物學的組成部分。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學
GC-MS非靶向代謝組學醫學分析生物樣本為何要衍生化處理？有哪些衍生化的方法？GC的流動相為氣體（通常為高純氦），這就要求被分析物必須能夠氣化，而生物樣本中很多內源性代謝物都含有極性基團，具有沸點高、不易氣化特點。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點，增加它們的熱穩定性，以便分析能夠順利進行。衍生化方法及試劑種類繁多，根據不同的分析目標，需選擇合適的衍生化方法。如分析脂肪酸，我們可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代謝平臺上，比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生，因為它的廣譜高效。在進行硅烷化衍生之前，還需添加甲氧胺吡啶溶液，以封閉羰基（針對α-酮酸和糖類，保護作用），減少衍生化副產物的生成。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學
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