PRM靶向蛋白組學：PRM技術是一種根據已知實測信息或質譜檢測規律的假定信息對樣品中的蛋白質進行靶向定量的技術。該技術主要應用儀器為QExactive系列質譜儀，首先以四極桿作為質量過濾器，特異性地選擇與預先設定質荷比相同的肽段離子（母離子）通過，隨后在高能碰撞池中碎裂母離子，之后通過Orbitrap分析碎片離子（子離子）得到肽段的二級質譜信息。四極桿的高選擇性離子過濾與Orbitrap高分辨率測量技術的結合使得PRM技術有很高的特異性，并且有效的降低了背景噪音，去除了干擾離子，提高了靈敏度。在確保數據質量的前提下，為了在一次分析中檢測更多的蛋白質，可用預置PRM（ScheduledPRM,sPRM）的方法，這種方法需要知道每個肽段的保留時間信息，使得每個肽段只在其洗脫時間窗口內執行PRM檢測，很大程度上提高了檢測效率，可同時檢測上百種蛋白質。PRM技術是目前應用較普遍的質譜蛋白質靶向定量技術。蛋白質組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的？江蘇定量乙酰化蛋白質組學服務
蛋白質組學發展趨勢：技術發展方面：蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存，各有優勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發展新方法外，更強調各種方法間的整合和互補，以適應不同蛋白質的不同特征。另外，蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要，這種交叉是新技術新方法的活水之源，特別是，蛋白質組學與其它大規模科學如基因組學，生物信息學等領域的交叉，構成組學（omics）生物技術研究方法，所呈現出的系統生物學（SystemBiology）研究模式，將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。湖北4D定量蛋白質組學研究方法蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優勢。
定量蛋白質組學技術：TMT定量蛋白組學技術：TMT(TandemMassTags)定量蛋白質組學技術多肽體外標記定量技術。這種技術采用多個（2-10）穩定同位素標簽，特異性標記多肽的氨基基團進行串聯質譜分析，能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量，可用于研究不同病理條件下或者不同發育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。iTRAQ定量蛋白組學技術是多肽體外標記定量技術。這種技術同TMT定量蛋白組學技術相似，可研究不同病理條件下或者不同發育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。
蛋白組學技術：質譜技術相較于傳統蛋白質鑒定技術而言，擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質譜鑒定蛋白質的基本原理是先將樣品分子離子化，然后根據不同離子之間的質荷比差異來分離并確定蛋白質的相對分子質量。根據蛋白質酶解后所得到的肽質量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質或核酸序列數據庫，質譜技術可達到對蛋白質的快速鑒定和高通量篩選。因產生離子的方法不同而發展起來的質譜包括基質輔助激光解吸離子化質譜、電噴霧離子化質譜、表面增強激光解吸離子化質譜等。蛋白質組學技術有等電聚焦。
蛋白質組學：質譜分析蛋白質組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質來進行分析，根據樣品的質量譜圖和相關信息從而得到定性和定量結果。目前，蛋白質組學質譜分析一般是根據保留時間（retentiontime）、質荷比（m/z）、離子強度（intensity）這三個維度對肽蛋白質進行鑒定和定量，即3D蛋白質組學。4D蛋白質組學在3D蛋白質組學的基礎之上增加了第四維度，離子淌度（mobility），主要根據離子的形狀和截面對離子進行分離，能夠區分m/z差值非常小的肽段，使低豐度蛋白信號能夠被區分和識別出來。4D蛋白質組學基于timsTOFPro質譜儀，結合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累積連續碎裂）與TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，離子遷移譜），可重復測量所有檢測離子的碰撞截面（CCS），能更快、更靈敏的進行蛋白質組定性和定量。蛋白質組學研究不僅是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業帶來巨大的利益。杭州常規蛋白質組學一般流程
蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念。江蘇定量乙酰化蛋白質組學服務
定量蛋白質組學方法學介紹：Label-free：Label-free定量，即非標記的定量蛋白質組學，不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free定量不需要標記處理，操作簡單，可以做任意樣本的總蛋白質差異定量，但對實驗操作的穩定性、重復性要求較高，準確性也較標記定量差。因此，Label-free技術適合于大樣本量的定量比較，以及對無法用標記定量實現的實驗設計。江蘇定量乙酰化蛋白質組學服務
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