蛋白質組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的？研究對象涉及到生物體且生物體內表達蛋白，理論上都可以應用蛋白質組學。蛋白質組學是以研究生物體蛋白組成及其變化規律為目的的應用科學。主要使用的儀器為液質聯用高分辨率質譜儀。詳細來說，蛋白質組學包含許多分支：非標定量蛋白質組學（定性研究生物體的蛋白組成），定量蛋白質組學（對生物體蛋白表達含量進行測定），修飾蛋白質組學（對蛋白質翻譯后修飾進行檢測）及相互作用蛋白質組研究（蛋白質直接相互作用機制解析）等。蛋白質組學屬于后基因組時代的科學研究，針對基因表達產物進行檢測與定量。因此更能反應出生物體生理條件下的水平與狀態。蛋白質組學包括蛋白質的表達水平。貴陽高通量蛋白質組學分析方法
蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質定性，或者說大規模檢測某些蛋白質是否存在于樣品當中；第2，蛋白質定量，也就是大規模檢測某些蛋白質的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規模，既可以是樣品數量的大規模高通量，也可以是少量樣本中蛋白數量的大規模高通量。研究原因：首先，由于翻譯調控和翻譯后調控的存在，RNA的表達量與實際對應蛋白質的含量相關性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質的定量相關性，結果是，低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高，經過平均后r值只為0.4。貴陽高通量蛋白質組學分析方法蛋白質組學由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。
LabelFree(非標記蛋白質組學技術)：在非標記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎，通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度；其二，以肽段被質譜檢測的計數為基礎，通過歸一化來表征被檢測蛋白質的相對豐度。非標記技術認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率（Counts）與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來，從而對蛋白質進行定量。
Labelfree非標記定量蛋白質組學技術特點：（1）不需要標記處理，操作簡單，成本低、實驗周期短；（2）每個樣品單獨處理、上機；（3）可以做任意樣本的總蛋白質差異定量，樣品類型不受限制；（4）對單個樣品的蛋白總量要求相對較低，對于組織本身蛋白量不高，可以選擇Label-Free，適用于一些難收集樣品；（5）定性沒有問題，但是定量的準確性較標記定量稍差，會受到質譜穩定性等因素的影響；（6）適合于大樣本量的定量比較（大于24個樣本）。蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學。蛋白質組學技術有等電聚焦。
PRM靶向定量蛋白質組學分析流程是怎樣的？要做PRM首先要明確目標蛋白（或多肽）是什么，設計和建立針對這些目標蛋白PRM質譜采集方法，然后對待測樣品進行PRM數據采集，將得到的原始譜圖數據導入分析軟件提取子離子信息進行定量。另外，如果配制已知濃度的標準肽段，用PRM額外做一個標準曲線，即可實現一定的定量。PRM靶向定量蛋白質組學技術能應用到哪些方面？研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過PRM技術來實現。具體說來，比如驗證定量蛋白質組學中某些蛋白的變化，多肽的相對和一定的定量，想做蛋白定量卻沒有抗體，針對蛋白修飾位點的定量，想同時定量多個蛋白的情況等，都可以用PRM來做。蛋白質組研究技術在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。貴陽高通量蛋白質組學分析方法
蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。貴陽高通量蛋白質組學分析方法
蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學，包括對蛋白質表達模式和蛋白質組功能模式的研究。蛋白質組學的發展對尋找疾病的診斷標志、篩選藥物靶點、毒理學研究等有重要意義，也因此被普遍應用于醫學研究。蛋白質組學研究，總體可分為一下幾個步驟：（1）差異篩選（Discovery）（2）初步驗證（Verification）（3）然后確診（Validation）?；谫|譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段，當前在醫療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫學。貴陽高通量蛋白質組學分析方法
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