m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態發布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。科研小白如何摸索自己的預實驗。廣西科研技術服務外包

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首先，預實驗必須要當做正式實驗來對待（態度要放端正，這是必須的）。預實驗的每一步都需要詳細規劃，多方籌謀。不論是實驗動物的選擇，還是檢測試劑的購買，都盡量和正式實驗統一標準。建議大家先把所有試劑和購買完畢后，再去購買實驗動物。因為動物會長胖，長胖后給劑量就要增加，不僅多花錢，并且還容易影響實驗效果。筆者曾經提前將實驗動物買回，但因為特殊原因沒能購買到造模，終只能忍痛割愛將動物贈送他人，白白虧了一筆血汗錢（那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖，沒辦法用作造模）。動物及試劑購買首先需要考慮：實驗動物品種、體重、性別、周齡（通常根據既往文獻報道可以獲得答案）、數量（需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆，因此需要提前購買足夠的動物）。動物購買的途徑、安置的地點，飲食管理（一般實驗室會有動物房，也可以從其他地方購買），動物免證明、倫理證明需要提前準備好。實驗相關的試劑和：比如造模和，動物干預所需，陽性選擇及購買（有些購買很困難，必須通過特殊程序才能買到）。如果涉及到有創操作，要提前準備好（建議提前購買），手術。需要了解自身實驗平臺能完成哪些技術。

保存于嚴密緊塞或加蓋的容器里，同時在容器外上標簽，并隨同材料在溶液中投入相應的標簽，以免相互混淆。標簽上注明固定液、材料來源、日期等。標簽上的文字，應用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項（1）脫水原理：乙醇與石蠟不相溶，而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當組織中全部被二甲苯占有時，光線可以透過，組織呈現出不同程度的透明狀態。（2）脫水必須在有蓋的玻璃品中進行，防止吸收空氣中的水分。（3）在更換高一級的脫水劑時，不要移動材料以免損壞，可用吸管吸出器皿中的脫水劑，再用吸水吸盡器皿內剩余液，然后于皿中加入高一級脫水劑。（4）在低濃度酒精中，每級停留不宜太長，否則易使組織變軟，助長材料的解體。（5）在高濃度或純酒精中，每級停留的時間也不宜太長，否則會使組織變脆，影響切片。（6）如需過夜，應停留在70%酒精中。（7）脫水必須徹底，否則不易透明，甚至使透明劑內出現白色混濁現象。4.透明注意事項（1）使用透明劑時，要隨時蓋緊蓋子，以免空氣中的水分進入。（2）更換每級透明劑，動作要迅速，一方面為了不使材料塊干涸，另一方面能避免吸收濕氣。（3）在透明過程中，如果材料周圍出現白色霧狀，說明材料中的水未被脫凈。上海研錄生物醫藥為您提供一站式科研技術服務。

如果實驗平臺的儀器需要提前預約，建議提前規劃好使用的時間。反復總結尋找答案在整個預實驗的過程中可能會出現很多問題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當、腹腔注射操作失誤、使用不當等引起動物死亡。每遇到問題都需要自己想辦法解決，可以從導師、師兄師姐、文獻、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給，發現有的大鼠得很深，有的大鼠還活蹦亂跳，在反復嘗試調整濃度，給劑量，更換方式，后來才發現是動物體重秤的準度有問題，導致體重秤得不準。因此，需要自己反復琢磨到底是實驗過程中哪一個環節出現問題，逐一排除。也要求在每一個實驗步驟需要標準化，統一化，盡可能的排除干擾因素，這樣方便在遇到問題快的找到答案。同時，建議每日總結，大到動物死亡原因分析，小到灌胃操作耗時多長時間。建議反復總結出每天實驗的優缺點。做任何一個操作之前，建議提前腦海中反復模擬，準備好相關工具和試劑，避免臨用之際缺少的，影響實驗操作節奏和個人心情。筆者曾經灌胃操作的時候發現竟然忘帶了，只好重新回實驗室準備，那真叫一個郁悶。仔細記錄每日實驗過程無論是碩士還是博士，導師給我們上的堂課往往就是交代我們要詳細記好實驗記錄，只要是和實驗相關的。細胞污染的處理的技術。廣西大鼠科研技術服務培養

飼養動物及干預 動物購買后需要將時間節點提前規劃好。廣西科研技術服務外包

m6A修飾圖譜構建及作用機制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數量及分布，Peak關聯基因的特征，聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節，作者研究了FOXM1的鄰近基因，發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補，且共表達、共定位，進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖，從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化，組蛋白修飾和染色質重構。近。廣西科研技術服務外包