RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。實驗干貨 | 分子克隆實驗——無縫克隆。天津外包科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

首先,預(yù)實驗必須要當(dāng)做正式實驗來對待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預(yù)實驗的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃,多方籌謀。不論是實驗動物的選擇,還是檢測試劑的購買,都盡量和正式實驗統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和藥物購買完畢后,再去購買實驗動物。因為動物會長胖,長胖后給藥劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實驗效果。筆者曾經(jīng)提前將實驗動物買回,但因為特殊原因沒能購買到造模藥物,**終只能忍痛割愛將動物贈送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖,沒辦法用作造模)。動物及試劑購買首先需要考慮:實驗動物品種、體重、性別、周齡(通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報道可以獲得答案)、數(shù)量(需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆,因此需要提前購買足夠的動物)。動物購買的途徑、安置的地點,飲食管理(一般實驗室會有動物房,也可以從其他地方購買),動物免疫證明、倫理證明需要提前準(zhǔn)備好。實驗相關(guān)的試劑和藥物:比如造模藥物和器械,動物干預(yù)所需藥物,陽***物選擇及購買(有些藥物購買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準(zhǔn)備好**物(***建議提前購買),手術(shù)器械。天津哪里有科研技術(shù)服務(wù)購買動物疾病模型作為研究工具,在探索疾病發(fā)展和檢查的過程中發(fā)揮了巨大的作用。

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小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴,引起輕微的血管擴張;用無菌手術(shù)刀、刀片或鋒利的剪刀,快速截斷小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次,之后每次需截除2-3毫米;從尾部像尾尖方向按摩,增加血流;用采集血液;結(jié)束后,按壓傷口或使用止血劑來止血;每次量大約可達(dá)。小鼠眼球取血單手保定好小鼠;必要時剪掉小鼠胡須,防止污染血液;輕壓取血側(cè)眼部皮膚,使眼球充血突出;用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘取;同時用左手中指輕按小鼠心臟部位,以加快心臟泵血速度;當(dāng)血液流盡時,用脫臼法處死小鼠;大鼠眼眶取血先將小鼠進(jìn)行麻醉,大鼠翻正反射消失時不在繼續(xù)麻醉;抗凝處理過的玻璃毛細(xì)采樣管,掰成2-3厘米長度;右手食指和拇指輕按眼眶兩側(cè)皮膚,使眼球突出,毛細(xì)管從內(nèi)側(cè)的眼球與眼瞼的縫隙處進(jìn)入,輕輕旋轉(zhuǎn)毛細(xì)管,稍微深入眼球后上方,血液流速快的時候4-5滴即可,溫柔的將毛細(xì)管取出;用棉簽按壓大鼠眼眶止血,每次可取血50-100微升,將血液放入冰盒中保存。小鼠心臟取血先將小鼠麻醉,稍靠右側(cè)平躺在手術(shù)板上固定;左側(cè)第三四根肋骨間觸摸心臟,跳動明顯,慢慢進(jìn)針;針有回血停止進(jìn)針,開始取血;一次可以300到500微升,小鼠存活,放到加熱墊上待小鼠蘇醒后放入籠中。科研小白如何摸索自己的預(yù)實驗。

RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個復(fù)合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基。以客戶需求為導(dǎo)向,提供個性化的科研技術(shù)服務(wù),助力科研項目的順利實施。天津哪里有科研技術(shù)服務(wù)購買
生物分子學(xué)是研究生命體系中分子結(jié)構(gòu)、功能和相互作用的學(xué)科。天津外包科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
實驗樣本分類實驗一般采取樣本有:血液樣本、樣本和細(xì)胞樣本。通常,樣本采集后,應(yīng)立即用等滲溶液(PBS或生理鹽水)盡量把血液漂洗干凈(除非血液也是分析對象),用濾紙或紗布吸干,把樣本分切成幾分,每份的體積約2個黃豆大小,每份用一個管子裝。血液樣本的采集應(yīng)根據(jù)不同實驗的要求,將會采取不同策略。血清樣本:全血中不加抗凝劑,血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黃色透明液體。(全血標(biāo)本室溫放置2小時3000rpm/min離心15min)血漿樣本:全血中加抗凝劑,血液凝固后取出的含凝血因子的淡黃色透明液體。(可用EDTA或肝素作為抗凝劑,標(biāo)本采集后30分鐘內(nèi)于2-8℃,3000rpm/min離心15min)如果是做生化\ELISA等檢測可以考慮血漿和血清,根據(jù)獲得的樣本量可考慮分裝成100-500μl/管,可避免反復(fù)凍融造成的檢測誤差。生化:建議優(yōu)先選擇血清,其次選擇肝素抗凝血漿;ELISA:建議優(yōu)先選擇血清,其次選擇肝素或EDTA抗凝血漿;凝血實驗:只能選擇枸櫞酸鈉抗凝血漿;血常規(guī):只能選擇EDTA抗凝全血;如果要收集其中的白細(xì)胞、血小板等建議用抗凝全血。如果要做流式建議用專門的流式用血液收集管,防止表面抗原的丟失,或者盡快安排就近檢測。樣本處理取樣完后。天津外包科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)