我們知道WB實驗步驟繁瑣,一次實驗歷時也不短,從提蛋白到顯影結束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關鍵環節。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經驗豐富的WB實驗者都深有體會,蛋白提取是影響結重要的環節之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點,一是裂解前注意保持樣品處于低溫環境中,二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會使蛋白提取不充分,加太多會讓蛋白濃度太低,一般經驗是這樣的,細胞樣品例如一個六孔板的細胞加60微升的裂解液,動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復抽吸1分鐘左右,注意不要產生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。裸鼠皮下成瘤模型造模意義.北京乳鼠科研技術服務培養

RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調控mRNA穩定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發現了METTL3(甲基轉移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統,內源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內生長。通過轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發現了在肝發生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。浙江疾病科研技術服務分離隨著跨學科研究的深入開展,動物疾病模型將在未來發揮更為普遍的作用,成為生命科學、醫學等領域研究工具。

是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發現的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結合能力,進而調控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發現FTO調節異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關,揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調節功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發現具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現出精子發生異常,這可能是精子發生相關基因表達改變的結果[7]。m6AmRNA修飾執行其功能主要通過兩個途徑:精細調控甲基化轉錄本的結構,以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結合蛋白識別,誘發續反應。目前一類含有YTH功能結構域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。
如果實驗平臺的儀器需要提前預約,建議提前規劃好使用的時間。反復總結尋找答案在整個預實驗的過程中可能會出現很多問題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當、腹腔注射操作失誤、使用不當等引起動物死亡。每遇到問題都需要自己想辦法解決,可以從導師、師兄師姐、文獻、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給,發現有的大鼠得很深,有的大鼠還活蹦亂跳,在反復嘗試調整濃度,給劑量,更換方式,后來才發現是動物體重秤的準度有問題,導致體重秤得不準。因此,需要自己反復琢磨到底是實驗過程中哪一個環節出現問題,逐一排除。也要求在每一個實驗步驟需要標準化,統一化,盡可能的排除干擾因素,這樣方便在遇到問題快的找到答案。同時,建議每日總結,大到動物死亡原因分析,小到灌胃操作耗時多長時間。建議反復總結出每天實驗的優缺點。做任何一個操作之前,建議提前腦海中反復模擬,準備好相關工具和試劑,避免臨用之際缺少的,影響實驗操作節奏和個人心情。筆者曾經灌胃操作的時候發現竟然忘帶了,只好重新回實驗室準備,那真叫一個郁悶。仔細記錄每日實驗過程無論是碩士還是博士,導師給我們上的堂課往往就是交代我們要詳細記好實驗記錄,只要是和實驗相關的。瘤細胞的增殖活性,從而更好地評估腫、瘤的惡性程度和預后.

代謝組學的研究對象大都是相對分子量在1000以內的小分子物質,因此常用的血液樣本在取樣后,應小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過程中許多細節容易忽略,造成數據不完美(甚至不能用)。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應新鮮,操作時間盡可能短,否則細胞發生死后變化、自融及現象。是動物心臟還在跳動時采集,樣本取出后在5分鐘以內置于固定液內,避免長時間暴露在空氣環境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內部。勿使塊受擠壓。在采集過程中,應盡量選擇較為鋒利的手術,如手術刀片等,避免操作過程中擠壓挫傷標本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內自由移動。盡量保持的原有形態。新鮮經固定后,或多或少產生收縮現象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準確的按解剖部位采集。動物模型的表現與人類疾病可能存在差異,因此需要謹慎使用。北京乳鼠科研技術服務培養
常用于研究細胞的成瘤能力、細胞的轉移、細胞的耐藥和靶分子對腫瘤細胞的發展的影響等等。北京乳鼠科研技術服務培養
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