m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章，小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識(shí)別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測(cè)序。對(duì)于無修飾的位點(diǎn)，ACA處被完全剪切，測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳，選擇紫外還是藍(lán)光？天津疾病模型科研技術(shù)服務(wù)分離

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR，作者確定了SOCS2（細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子）作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之，METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此，作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。海南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)購買動(dòng)物疾病模型可以分為兩種類型：自然模型和人工模型。

注意事項(xiàng)1.病毒包裝的幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)主要包括：細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時(shí)的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)Σ《景b影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會(huì)影響到是否能包裝成功)。，需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮：病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話，也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基，但是可能效果會(huì)不太好。并且一般收病毒時(shí)，培養(yǎng)基的營養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多，那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會(huì)損害細(xì)胞，所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時(shí)293T細(xì)胞狀態(tài)不好，或者鋪得過密，可以選擇放棄該次實(shí)驗(yàn)。2.目的載體過大，不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。

必須仔細(xì)考慮所有可能影響實(shí)驗(yàn)的條件和技術(shù)參數(shù)以獲得可重復(fù)且一致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此，要求實(shí)驗(yàn)人員深入了解和熟練掌握操作過程才能準(zhǔn)確地構(gòu)建CLP模型。造模評(píng)價(jià)該模型通過模型動(dòng)物自身引發(fā)膿毒癥，與臨床膿毒癥類似的地方在于有連續(xù)分散的細(xì)菌源，血中內(nèi)檢出率及細(xì)菌培養(yǎng)陽性率高，動(dòng)物體溫降低以及血流動(dòng)力學(xué)早期高排低阻晚期低排低阻的特征也與臨床相仿，在建模的同時(shí)模擬臨床膿毒癥方法，輔以充分的液體復(fù)蘇和適當(dāng)輔助(如藥物)，另外這個(gè)模型可控性高，標(biāo)準(zhǔn)化水平高。該模型中膿毒癥的嚴(yán)重程度受3個(gè)重要因素的影響：結(jié)扎盲腸的長度、穿孔針的大小和CLP后的支持。結(jié)扎盲腸的長度是死亡率的主要決定因素，隨著結(jié)扎盲腸的長度的增加，促炎細(xì)胞因子的水平也在增加。來源：[1]李晗,田李均,韓旭東.膿毒癥體內(nèi)外模型研究進(jìn)展.中國與化療雜志,2020,20(01):.[2]彭鳳輝,鄧曉彬,呂立文.膿毒癥動(dòng)物模型的研究進(jìn)展.廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2020,37。建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。

痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型【簡介】痙攣性腦癱指發(fā)育異常引起的運(yùn)動(dòng)和感覺功能落后，造成肢體肌張力增高、腱反射亢進(jìn)等一系列綜合征。本實(shí)驗(yàn)利用腦立體定位解剖圖譜,對(duì)大鼠的錐體束部位進(jìn)行精確的立體定位,通過微量注射器對(duì)大腦錐體束所在部位注射無水乙醇造成錐體束壞死,的模擬了痙攣型腦癱的解剖學(xué)及病理改變,術(shù)后大鼠產(chǎn)生明顯的屈曲痙攣癥狀,且屈肌肌張力增高,癥狀和體持續(xù)時(shí)間較長,穩(wěn)定性良好。從而建立一種可復(fù)制性良好且痙攣持續(xù)時(shí)間較長的穩(wěn)定的大鼠痙攣型腦癱動(dòng)物模型,為進(jìn)一步深入的探究痙攣型腦癱的基礎(chǔ)研究和臨床診治打下基礎(chǔ)【目的】痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型建立【動(dòng)物】SPF級(jí)SD大鼠，雄性，周齡6~8W，體重：200~250g【方法】1、大鼠麻醉，顱頂脫毛備皮；2、大鼠腦定位儀固定大鼠，顱頂正中切口，長度約2cm開口暴露前囟及矢狀縫；3、縫線將皮膚左右分開固定，前囟后10mm、矢狀縫左側(cè)；4、微量注射器移至開孔處修正骨孔，注射器垂直向顱內(nèi)插入，緩慢注射無水乙醇15ul，注射完移除注射器，棉球壓迫止血；5、縫合創(chuàng)口后維持25°體溫，等待蘇醒，觀察大鼠狀態(tài)。【觀察】術(shù)后3天模型大鼠攝食減少、右側(cè)肢體跛行、右前肢不負(fù)重、右前肢及右前爪屈曲痙攣明顯。細(xì)胞污染的處理的技術(shù)。北京外包科研技術(shù)服務(wù)購買

可以穩(wěn)定的WB精髓與經(jīng)驗(yàn)分享。天津疾病模型科研技術(shù)服務(wù)分離

如胰腺，一般取胰島較多的胰腺尾部；肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實(shí)驗(yàn)需進(jìn)行多樣本的采集，采集順序應(yīng)按照：消化，神經(jīng)系統(tǒng)，皮膚，肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排，然后決定其切面的走向；如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等，應(yīng)盡可能掉，否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定（1）固定的方法：①小塊固定法：從動(dòng)物取下的小塊，立即置入液態(tài)固定劑（這是應(yīng)用經(jīng)常的方法）。②注射/灌注固定法：某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對(duì)整個(gè)臟器或整個(gè)動(dòng)物進(jìn)行固定，這時(shí)宜采用注射固定法，將固定液注入血管，經(jīng)血管分支到達(dá)整個(gè)和全身，從而得到充分的固定。另，空腔比如肺，肺內(nèi)含有空氣，固定液難以滲入，建議先做肺灌注，使得肺充盈滿固定液以后再進(jìn)行保存，如果空腔中氣體沒有排出，后續(xù)可能影響固定效果（沒有灌注的肺會(huì)浮在液體表面不利于固定，切片以后也會(huì)看到很多的空泡）。③蒸汽固定法：比較細(xì)小而薄的標(biāo)本，可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。。天津疾病模型科研技術(shù)服務(wù)分離