且研究表明HNRNPC通過m6A與RNA結合調控目標轉錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統[10]m6A生物學功能越來越多的證據表明m6A修飾在哺乳動物中發揮重要的生物功能。例如,在轉錄水平上調控RNA的穩定性[11]、定位[12]、運輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發現依賴METTL3的pri-miRNA甲基化,會促進DGCR8識別和加工,從而促進microRNA的成熟[15]。此外,m6A識別蛋白HNRNPA2B1促進pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環狀RNA上m6A的修飾能促進環狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達調控中起著重要的作用,其調控機制的異常可能與人類疾病或相關。目前發現m6A可能會影響精子發育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導的DNA損傷反應(METTL3,FTO)、生成(YTHDF2)或轉移(METTL14)、干細胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節律、細胞發育分化、細胞分裂及其它的一些生命過程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點是凋亡影響減數分裂中期的精子細胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細胞中,METTL3的敲除嚴重抑制精子分化和減數分裂的發生。純干貨Western blot (WB)條帶灰度統計與GraphPad作圖.湖南疾病模型科研技術服務實驗室

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m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。
外泌體生物發生和神經元細胞中分泌小泡的調節之間的交集為外泌體和神經退行性疾病的發病機制之間假定的聯提供了新的見解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比,外泌體中的研究進展迅速,而且外泌體與的幾個主要特征有關。外泌體影響、生長和轉移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進展中的作用可能是動態的,并且與的類型、遺傳學和分期有關。外泌體的應用外泌體用于免疫基于免疫細胞來源的外泌體能夠介導和調節機體對的免疫反應,外泌體在免疫方面的潛力受到關注。其中樹枝狀細胞產生的外泌體包含大量的MHC-多肽復合物和免疫刺激相關的分子,能夠相關的T細胞,介導體內抗應答,在多個臨床試驗中表現出良好的抗療效。有研究者考察了樹枝狀細胞外泌體對非小細胞肺患者的療效。結果表明,患者對樹枝狀細胞外泌體耐受性良好,1/3患者表現出了對樹枝狀細胞外泌體的T細胞響應,2/4患者自然殺傷細胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹突狀細胞外泌體免疫轉移性黑色素瘤的臨床一期試驗結果,發現自體樹突狀細胞外泌體無明顯毒性,并且具有刺激自然殺傷細胞的能力。以上臨床試驗證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性,為進一步臨床研究奠定了基礎。動物疾病模型:為人類健康保駕護航。

圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測的特異性位點是否準確呢?作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標記層析檢測,發現預測的位點準確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較,也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態和酵母減數分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統;并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術,其他部分暫不過多分析了。新的技術能拓展我們的研究內容;對于這一技術。進行免疫沉淀法時,抗體需要和一個受質結合。浙江疾病模型科研技術服務購買
細胞器是細胞內的各種功能結構,如線粒體、內質網、高爾基體等,它們各自承擔著不同的生理功能。湖南疾病模型科研技術服務實驗室
我們知道WB實驗步驟繁瑣,一次實驗歷時也不短,從提蛋白到顯影結束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關鍵環節。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經驗豐富的WB實驗者都深有體會,蛋白提取是影響結重要的環節之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點,一是裂解前注意保持樣品處于低溫環境中,二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會使蛋白提取不充分,加太多會讓蛋白濃度太低,一般經驗是這樣的,細胞樣品例如一個六孔板的細胞加60微升的裂解液,動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復抽吸1分鐘左右,注意不要產生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。湖南疾病模型科研技術服務實驗室