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m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。云南組織科研技術服務分離裸鼠皮下成瘤模型造模意義.

建議按照2×106每孔的數量將293T細胞均勻鋪入。(2)第二天:在24小時之內,觀察293T細胞的匯合度在90%~95%之間時,向其中加入DNA-脂質體復合體,DNA-脂質體復合體制備方法如下:a)輕輕混勻LipoMax,根據說明書加入相應量于500μlOpti-MEM無血清培養基中,混合均勻并置于室溫5分鐘。b)在500μlOpti-MEM無血清培養基中稀釋DNA,總質量為15μg按照載體質粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)將稀釋后的LipoMax和稀釋后的DNA輕輕混勻,常溫靜置20分鐘,形成DNA-LipoMax復合體。(3)將DNA-LipoMax復合體輕柔地滴加至細胞培養皿中,輕輕搖晃培養皿混勻,放入細胞培養箱中培養。(4)病毒收集濃縮病毒:加入DNA-LipoMax復合體48小時后,收集病毒上清,同時加入10ml預溫的293T培養基到細胞培養皿中。將收集到的病毒上清存在4℃冰箱中;收集72小時病毒上清,與48小時病毒上清混在一起。將離心機溫度降溫到4℃,600g,離心5分鐘,去除其中的細胞碎片,上清液經μm濾頭過濾,加入病毒濃縮液,配制濃縮病毒液。將濃縮后的病毒放于4℃冰箱搖床上,旋轉過夜。第二天,4度離心機,3000~4000g離心15分鐘。棄掉上清液,加入1Xpbs或培養基重懸。
首先,預實驗必須要當做正式實驗來對待(態度要放端正,這是必須的)。預實驗的每一步都需要詳細規劃,多方籌謀。不論是實驗動物的選擇,還是檢測試劑的購買,都盡量和正式實驗統一標準。建議大家先把所有試劑和藥物購買完畢后,再去購買實驗動物。因為動物會長胖,長胖后給藥劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實驗效果。筆者曾經提前將實驗動物買回,但因為特殊原因沒能購買到造模藥物,**終只能忍痛割愛將動物贈送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖,沒辦法用作造模)。動物及試劑購買首先需要考慮:實驗動物品種、體重、性別、周齡(通常根據既往文獻報道可以獲得答案)、數量(需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆,因此需要提前購買足夠的動物)。動物購買的途徑、安置的地點,飲食管理(一般實驗室會有動物房,也可以從其他地方購買),動物免疫證明、倫理證明需要提前準備好。實驗相關的試劑和藥物:比如造模藥物和器械,動物干預所需藥物,陽***物選擇及購買(有些藥物購買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創操作,要提前準備好**物(***建議提前購買),手術器械。細胞轉染又分為瞬時轉染和穩定轉染,瞬時轉染是指外源基因進入受體細胞后.

原理HE染色主要使用蘇木精和伊紅這兩種染液,其中蘇木精堿性染液為藍色,可以將組織的酸性結構染成藍紫色(細胞核呈現藍色;軟骨基質、鈣鹽顆粒呈深藍;粘液呈灰藍);伊紅是一種化學合成的酸性染料,在水中解離成帶負電荷的陰離子,易于蛋白質氨基中的正電荷結合使細胞漿染色。細胞漿、肌肉、結締組織、嗜伊紅顆粒等被染成不同程度的紅色或粉紅色。材料與儀器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蠟、蜂蠟蘇木精染液、伊紅酒精溶液、鹽酸酒精溶液甘油蛋白粘片劑、中性樹膠石蠟包埋機、切片機、恒溫箱、蠟杯酒精燈、解剖剪、培養皿、鑷子、單面刀片染色缸、蓋玻片、載玻片、玻片盤、顯微鏡溫度計、水浴鍋步驟一、制作卵巢石蠟切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥鈉(50mg/kg)進行麻醉,頸椎脫臼法處死小鼠,取出雙側卵巢。取下所需組織,切成一小塊3~4mm厚。2、固定、洗滌、脫水(1)將切好的卵巢組織用生理鹽水洗一下,使用中性福爾馬林固定液固定30~50min。后用流水沖洗3次,每次5min。(2)卵巢組織依次經70%、80%、90%乙醇溶液脫水,各30min。(3)再放入95%、100%乙醇溶液各2次,每次20min。3、透明、透蠟(1)使用純酒精、二甲苯等量混合液處理組織15min。可以普遍應用于生物醫學研究、藥物篩選、腫、瘤診斷等領域。北京組織科研技術服務培養
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把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形,這里的寬與長相對應)不大于8毫米,我習慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜,一般是12-18個小時,注意放置水平,用搖床。內參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現條帶連在一起的情況,這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細節可能有些同學沒注意到,就是ECL發光液要與HRP反應一分鐘后顯影效果才會更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。北京科研技術服務培養