轉錄組測序結果及TCGA數據庫分析）圖5RNA-Seq和m6A-seq聯合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中，都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中，通過敲除m6A甲基轉移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調控。進一步通過MeRIP-Seq發現相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析，他們發現了區分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達的轉錄調控的復雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩定狀態的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。常用于研究細胞的成瘤能力、細胞的轉移、細胞的耐藥和靶分子對腫瘤細胞的發展的影響等等。天津乳鼠科研技術服務構建

m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態發布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。寧夏裸鼠科研技術服務外包動物疾病模型是一種用于研究人類疾病的重要工具。

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注意事項1.病毒包裝的幾個關鍵點主要包括：細胞因素、載體系統(盡量使用成熟的商業化載體系統)、構建重組的質粒正確與否、質粒抽提純化情況、包裝轉染控制(24、48小時的細胞及熒光狀態判斷)、目的基因對病毒包裝影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會影響到是否能包裝成功)。，需要觀察包裝病毒后的48h培養基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮：病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話，也可以直接將收集的病毒上清作為要的細胞的培養基，但是可能效果會不太好。并且一般收病毒時，培養基的營養已經損耗了很多，那樣直接培養細胞會損害細胞，所以建議還是進行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時293T細胞狀態不好，或者鋪得過密，可以選擇放棄該次實驗。2.目的載體過大，不易。3.避免轉染過程以及后續過程出現的污染。干貨分享｜選對實驗室常用培養基DMEM和1640。

原理以慢病毒包裝為例，主要包括3個質粒：質粒DNA可以轉錄出慢病毒遺傳物質(RNA)，但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質粒，其同時含有目的基因和報告基因，psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質粒，其表達產物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質粒，通過脂質體進行三質粒共轉到靶細胞基因組中，宿主基因組在表達時，隨宿主基因轉錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后，其遺傳物質RNA逆轉錄出DNA，該基因再整合到靶細胞的基因組中，完成轉染過程。因為質粒DNA只能轉錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分，因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復增殖，故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉染到靶細胞基因組中。用途病毒產生，包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS，對數期293T細胞，細胞計數器，病毒質粒(以慢病毒為例：psPAX2/)，轉染試劑(lipMax或者lipo3000)，Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數生長期的293T細胞，用的胰蛋白酶消化293T細胞，計數。若是10cm大皿，建議按照10-12×106每皿的數量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。細胞由細胞膜、細胞質、細胞核和細胞器等組成。細胞膜是細胞的外層，它控制物質的進出。廣西組織科研技術服務分離

實驗技巧——做好細胞凍存，保證細胞質量。天津乳鼠科研技術服務構建

原理HE染色主要使用蘇木精和伊紅這兩種染液，其中蘇木精堿性染液為藍色，可以將組織的酸性結構染成藍紫色（細胞核呈現藍色；軟骨基質、鈣鹽顆粒呈深藍；粘液呈灰藍）；伊紅是一種化學合成的酸性染料，在水中解離成帶負電荷的陰離子，易于蛋白質氨基中的正電荷結合使細胞漿染色。細胞漿、肌肉、結締組織、嗜伊紅顆粒等被染成不同程度的紅色或粉紅色。材料與儀器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蠟、蜂蠟蘇木精染液、伊紅酒精溶液、鹽酸酒精溶液甘油蛋白粘片劑、中性樹膠石蠟包埋機、切片機、恒溫箱、蠟杯酒精燈、解剖剪、培養皿、鑷子、單面刀片染色缸、蓋玻片、載玻片、玻片盤、顯微鏡溫度計、水浴鍋步驟一、制作卵巢石蠟切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥鈉（50mg/kg）進行麻醉，頸椎脫臼法處死小鼠，取出雙側卵巢。取下所需組織，切成一小塊3~4mm厚。2、固定、洗滌、脫水（1）將切好的卵巢組織用生理鹽水洗一下，使用中性福爾馬林固定液固定30~50min。后用流水沖洗3次，每次5min。（2）卵巢組織依次經70%、80%、90%乙醇溶液脫水，各30min。（3）再放入95%、100%乙醇溶液各2次，每次20min。3、透明、透蠟（1）使用純酒精、二甲苯等量混合液處理組織15min。天津乳鼠科研技術服務構建