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原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質粒:質粒DNA可以轉錄出慢病毒遺傳物質(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質粒,其表達產物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質粒,通過脂質體進行三質粒共轉到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質RNA逆轉錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉染過程。因為質粒DNA只能轉錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉染到靶細胞基因組中。用途病毒產生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數期293T細胞,細胞計數器,病毒質粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。廣西外包科研技術服務外包慢病毒載體包含了包裝、轉染、穩定整合所需要的遺傳信息。

m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。
RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調控mRNA穩定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發現了METTL3(甲基轉移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統,內源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內生長。通過轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發現了在肝發生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。外泌體在生物醫學方面有哪些應用。

建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此,疾病模型研究結果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來就讓上海研錄帶您了解相關知識。一個好的疾病模型應具有以下特點:①能夠再現所要研究的人類疾病,動物疾病表現應該與人類疾病相似;②動物能重復產生該疾病,盡可能能在兩種動物體內復制該病;③動物背景資料完整,實驗動物合格,生命周期要滿足實驗需要;④動物要價廉、來源充足、便于運送;⑤盡可能選用小動物。生物醫學科研專業設計中常要考慮如何建立動物模型的問題,因為很多闡明疾病及療效機制的實驗不可能或不應該在患者身上進行。常要依賴于復制動物模型,但一定要進行周密設計,設計時要遵循下列一些原則:(一)相似性在動物身上復制人類疾病模型,目的在于從中找出可以推演應用于患者的有關規律。外推法(extrapolation)要冒風險,因為動物與人到底不是一種生物。如,在動物身上無效的藥物不等于臨床無效,反之亦然。因此,設計動物疾病模型的一個重要原則是,所復制的模型應盡可能近似于人類疾病的情況。能夠找到與人類疾病相同的動物自發性疾病當然是比較好的。(二)重復性理想的動物模型應該是可重復的,甚至是可以標準化的。如。干貨分享|選對實驗室常用培養基DMEM和1640。乳鼠科研技術服務技術
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且研究表明HNRNPC通過m6A與RNA結合調控目標轉錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統[10]m6A生物學功能越來越多的證據表明m6A修飾在哺乳動物中發揮重要的生物功能。例如,在轉錄水平上調控RNA的穩定性[11]、定位[12]、運輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發現依賴METTL3的pri-miRNA甲基化,會促進DGCR8識別和加工,從而促進microRNA的成熟[15]。此外,m6A識別蛋白HNRNPA2B1促進pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環狀RNA上m6A的修飾能促進環狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達調控中起著重要的作用,其調控機制的異常可能與人類疾病或相關。目前發現m6A可能會影響精子發育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導的DNA損傷反應(METTL3,FTO)、生成(YTHDF2)或轉移(METTL14)、干細胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節律、細胞發育分化、細胞分裂及其它的一些生命過程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點是凋亡影響減數分裂中期的精子細胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細胞中,METTL3的敲除嚴重抑制精子分化和減數分裂的發生。云南裸鼠科研技術服務構建