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來源: 發布時間:2024-03-04

RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調控mRNA穩定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發現了METTL3(甲基轉移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統,內源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內生長。通過轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發現了在肝發生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。隨著科技的不斷進步,科研人員將能夠開發出更為精確、實用的動物模型,更好地為人類健康保駕護航。科研技術服務培養

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把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形,這里的寬與長相對應)不大于8毫米,我習慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜,一般是12-18個小時,注意放置水平,用搖床。內參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現條帶連在一起的情況,這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細節可能有些同學沒注意到,就是ECL發光液要與HRP反應一分鐘后顯影效果才會更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。河北疾病模型科研技術服務構建常見的5種實驗動物取血方式,你掌握幾種?

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注意事項1.病毒包裝的幾個關鍵點主要包括:細胞因素、載體系統(盡量使用成熟的商業化載體系統)、構建重組的質粒正確與否、質粒抽提純化情況、包裝轉染控制(24、48小時的細胞及熒光狀態判斷)、目的基因對病毒包裝影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會影響到是否能包裝成功)。,需要觀察包裝病毒后的48h培養基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮:病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話,也可以直接將收集的病毒上清作為要的細胞的培養基,但是可能效果會不太好。并且一般收病毒時,培養基的營養已經損耗了很多,那樣直接培養細胞會損害細胞,所以建議還是進行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時293T細胞狀態不好,或者鋪得過密,可以選擇放棄該次實驗。2.目的載體過大,不易。3.避免轉染過程以及后續過程出現的污染。

METTL3能夠促進肺腺細胞的生長、生存和侵襲,但還不清楚它是否作為m6A調節器或效應器發揮作用[25]。在急性髓細胞白血病(AML)患者中,m(6)A調控基因的突變或拷貝數變化與TP53突變存在密切聯系,且m(6)A調控基因的改變與AML不良預相關[26]。此外,FTO在AML中高表達,它通過降低mRNA轉錄本中的m(6)水平,調節ASB2和RARA等靶點的表達,增強了白血病基因介導的細胞轉化和白血病形成,并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導的AML細胞分化[27]。在脂肪形成過程中,FTO表達與m6A水平成負相關,促進脂肪形成[3]。在膠質細胞瘤樣細胞中,ALKBH5通過lncRNAFOXM1介導FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質瘤細胞的成瘤性[28]。此外,甲基轉移酶METTL3或METTL14的敲除,能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達,極大地促進了膠質瘤細胞的生長、自我更新和形成[29]。圖2m6ARNA修飾和介導的功能[30]m6A的研究方向主要是通過研究m6A修飾相關的甲基化、去甲基化酶和識別蛋白的功能,進而研究m6A修飾的生物學功能和作用機制:一般通過敲除m6A酶分子,研究下游功能基因分子的表達和m6A甲基化情況,通過介導相關基因異常(可變剪切、穩定性、翻譯、miRNA調控)影響細胞表型和功能特征。在疫苗測試中,動物模型則可以用來評估疫苗的有效性和安全性。

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是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發現的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結合能力,進而調控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發現FTO調節異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關,揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調節功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發現具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現出精子發生異常,這可能是精子發生相關基因表達改變的結果[7]。m6AmRNA修飾執行其功能主要通過兩個途徑:精細調控甲基化轉錄本的結構,以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結合蛋白識別,誘發續反應。目前一類含有YTH功能結構域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳,選擇紫外還是藍光?江蘇實驗科研技術服務培養

生物分子學是研究生命體系中分子結構、功能和相互作用的學科。科研技術服務培養

轉錄組和m6A分析顯示精子發生相關基因的表達和選擇性剪接發生了改變[19]。YTHDC2可促進靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發生過程中起關鍵作用。當減數分裂開始時YTHDC2表達上調,YTHDC2敲除小鼠的生殖細胞沒有經過偶線期的發育導致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應中,METTL3可促進DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點,當缺失METTL3時,細胞無法迅速修復UV照射引起的突變,并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細胞性小鼠過繼轉移模型中,Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達水平,從而抑制IL-7介導的STAT5活性和T細胞內穩態增殖和分化,進而抑制腸炎的發生[21]。在肝中,METTL14通過調控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉移[22]。在乳腺細胞中,低氧刺激能促進依賴低氧誘導因子HIF的ALKBH5的表達,而ALKBH5過表達降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩定mRNA提高NANOG的表達水平,終增加乳腺干細胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導乳腺細胞中依賴ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉移[24]。在肺中。科研技術服務培養

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